合资公司一方撤资，另一方继续经营时，员工处理需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若撤资方与继续经营方协商一致，员工劳动关系可依法转移
   根据《劳动合同法》第三十四条，用人单位发生合并、分立等情形的，原劳动合同继续有效，由承继其权利义务的用人单位继续履行。若撤资方退出后，公司主体存续（如仅股权变更），员工劳动关系不受影响，继续由原公司履行合同；若公司主体变更（如新设公司承接业务），需与员工协商一致后签订变更协议，明确由新主体承继劳动关系，且工作年限连续计算。
   操作建议：

   • 签订三方协议（原公司、新公司、员工），明确权利义务转移；
     
   • 保留员工工龄连续计算的证据（如工资记录、社保缴纳记录）；
     
   • 依法办理用工主体变更登记。

2. 若撤资导致公司解散，需依法终止劳动关系并支付补偿
   若撤资方退出后，公司因无法继续经营而解散，根据《劳动合同法》第四十四条、第四十六条，公司需提前30日书面通知员工或支付代通知金，并按员工工作年限支付经济补偿（每满1年支付1个月工资）。
   操作建议：

   • 依法成立清算组，通知债权人并公告；
     
   • 优先清偿员工工资、社保、经济补偿等债务；
     
   • 避免以“撤资”为由直接解除合同，需以“公司解散”为法定事由。

3. 若撤资方单方强制撤资，员工可主张违法解除赔偿
   若撤资方未通过合法程序（如股东会决议、清算）退出，导致公司违法解除员工合同，员工可根据《劳动合同法》第四十八条、第八十七条，要求公司按经济补偿标准的2倍支付赔偿金。
   操作建议：

   • 收集公司违法解除的证据（如解除通知、股东会决议缺失证明）；
     
   • 优先通过劳动仲裁主张权利，再考虑诉讼；
     
   • 注意1年仲裁时效的限制。

4. 特殊情形：员工选择留任或离职的自主权
   若公司主体存续但经营方向调整，员工有权根据《劳动合同法》第三十八条，以“未提供劳动条件”为由解除合同并主张经济补偿；若员工同意留任，需签订书面协议确认工作内容、待遇等变更。
   操作建议：

   • 留任员工需明确岗位、薪资调整是否合法；
     
   • 离职员工需保留书面解除通知，避免口头协商的举证风险。

总结：员工处理需结合撤资方式（股权转让/公司解散）、是否协商一致、是否违法解除等关键因素，建议优先通过协商、协议变更劳动关系，若无法达成一致，需依法主张补偿或赔偿。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询细节。