结论：已开工项目招标文件与施工合同不符合，是否可以行政处罚需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 行政处罚的法律依据与条件：

   • 行政处罚通常针对违反行政法规、规章的行为。在建设工程领域，若招标文件与施工合同的不符合涉及违反《中华人民共和国招标投标法》等相关法律法规的强制性规定，如未按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同，或者订立背离合同实质性内容的协议，则可能面临行政处罚。
   • 具体来说，如果这种不符合导致了不公平竞争、损害国家利益或社会公共利益等后果，行政机关有权依据相关法律法规进行处罚。

2. 招标文件与施工合同不符合的具体情形：

   • 内容不一致：若招标文件与施工合同在关键条款上存在显著差异，如工程范围、工期、质量标准、价款等，且这种差异无法合理解释或未得到双方认可，则可能构成违约或违法行为。
   • 程序违规：若招标过程存在违规行为，如未按照法定程序进行招标、评标，或者中标后未按照招标文件签订合同等，也可能导致行政处罚。

3. 行政处罚的可能形式：

   • 根据违法行为的性质和情节，行政处罚可能包括警告、罚款、没收违法所得、责令停业整顿、吊销资质证书等。
   • 在建设工程领域，对于严重违反招标投标法规的行为，行政机关可能会采取较为严厉的处罚措施，以维护市场秩序和公平竞争。

4. 实际案例与司法实践：

   • 在实际案例中，法院或行政机关会根据具体事实和法律法规进行裁决。如果招标文件与施工合同的不符合被认定为违法行为，且造成了严重后果，那么行政处罚的可能性就会增加。
   • 同时，司法实践也强调对违法行为的惩处与对合法行为的保护并重，确保市场主体的合法权益得到维护。

5. 建议与应对措施：

   • 对于已开工项目招标文件与施工合同不符合的情况，建议双方首先进行协商，尝试通过友好方式解决分歧。
   • 如果协商无果，且认为对方行为可能构成违法或违约，可以寻求法律途径解决，如向行政机关投诉、提起民事诉讼等。
   • 在处理此类问题时，应充分了解相关法律法规和司法实践，以便更好地维护自身权益。

进一步思考：在建设工程领域，招标文件与施工合同的一致性对于确保项目顺利进行、维护市场秩序和公平竞争具有重要意义。因此，双方在签订合同时应严格遵守相关法律法规和招标文件的规定，确保合同内容的合法性和有效性。如果遇到招标文件与施工合同不符合的情况，应及时咨询专业律师或相关机构，以便得到专业的法律建议和帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。