员工合作协议书在符合一定条件下是受法律保护的。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
主体适格：
- 员工与公司作为协议书的双方，必须具备相应的民事行为能力。员工需达到法定年龄，具有正常的认知和判断能力；公司则必须是依法设立且具有相应民事行为能力的主体。只有双方主体适格，协议书才具有法律效力。
意思表示真实：
- 协议书中的内容必须是双方真实意愿的表达，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。如果协议书是在一方被欺诈或胁迫的情况下签订的，那么该协议书可能被视为无效或可撤销。因此，在签订协议书时，双方应确保意思表示真实，以维护协议书的法律效力。
内容合法合规：
- 协议书的内容不得违反法律法规的强制性规定，也不能违背社会公共秩序和善良风俗。例如，协议书中不能包含限制员工合法权益、规避税收等违法条款。如果协议书内容违法，那么该协议书将无效，不受法律保护。
形式符合要求：
- 虽然协议书的形式可以是书面、口头或其他形式，但为了确保协议书的证据效力和明确性，建议采用书面形式。此外，如果协议书涉及特定类型或需要办理批准、登记等手续，那么双方应及时办理相关手续，以确保协议书的生效。
在实际应用中，员工合作协议书通常包括以下关键条款，这些条款的合法性和合理性将直接影响协议书的法律效力：
- 合作内容：明确双方的合作范围、职责和分工，确保合作内容合法合规。
- 合作期限：规定合作的起始和结束时间，以及可能的续签条件。
- 利益分配：明确双方在合作中的利益分配方式，如利润分成、股权分配等，确保利益分配公平合理。
- 保密条款：规定双方在合作期间及合作结束后对商业秘密、技术秘密等的保密义务，以保护双方的合法权益。
- 违约责任：明确双方在违反协议书时应承担的责任和赔偿方式，以约束双方的行为并保障协议书的履行。
如果员工合作协议书存在无效或部分无效的情形，如欺诈、胁迫、内容违法等，那么该协议书将不受法律保护。在这种情况下，员工可以通过法律途径维护自己的合法权益，如提起诉讼或申请仲裁等。
建议：
- 在签订员工合作协议书前，双方应仔细审查协议书的内容，确保协议书符合上述条件并具有法律效力。
- 如果对协议书的法律效力存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律意见和帮助。
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