针对“违章建筑占有权之诉怎么处理”这一问题，核心结论是：违章建筑占有权之诉的处理需结合违章建筑的性质、诉讼类型及法律程序综合判断，通常需通过行政程序先行确认违章性质，再通过民事诉讼解决占有权争议，或直接通过民事诉讼主张权利但面临一定风险。以下分情况详细说明：

1. 若违章建筑已被行政机关认定为违法建筑

• 行政程序前置：根据《城乡规划法》第六十四条，行政机关（如规划部门、城管部门）有权对违章建筑作出限期拆除、罚款等行政处罚。若建筑已被认定为违章，占有权争议通常需先通过行政复议或行政诉讼解决行政处罚的合法性问题。
• 民事诉讼的局限性：若直接提起民事诉讼主张占有权，法院可能以“违章建筑不具有合法物权”为由驳回起诉，或仅处理占有使用的事实状态（如返还占有、赔偿损失），但不确认所有权。

2. 若违章建筑尚未被行政机关认定，但存在占有权争议

• 民事诉讼路径：当事人可提起“占有保护纠纷”之诉，依据《民法典》第四百六十二条（占有保护请求权）主张返还原物、排除妨害等。此时法院会审查占有的事实状态（如实际控制、使用时间等），但不会对建筑合法性作出最终认定。
• 风险提示：若对方在诉讼中提出建筑违章的抗辩，法院可能中止民事诉讼，建议当事人先通过行政程序确认建筑性质，再恢复审理。

3. 特殊情形：历史遗留或政策性违章建筑

• 政策考量：部分违章建筑因历史原因（如早期建设未完善手续）或政策允许（如农村自建房）存在，可能通过补办手续转化为合法建筑。此时占有权争议需结合地方政策处理，可能涉及行政协商或民事调解。
• 司法实践倾向：法院在处理此类案件时，可能更注重实际占有状态和社会稳定，避免简单以“违章”为由剥夺占有权益。

4. 诉讼策略建议

• 证据收集：重点收集占有事实的证据（如水电费缴纳记录、物业证明、邻居证言等），以及建筑形成时间的证据（如建设合同、规划许可申请材料等）。
• 程序选择：若建筑合法性存疑，建议优先通过行政复议或行政诉讼确认行政处罚的合法性，再处理占有权争议；若建筑合法性明确（如已补办手续），可直接提起民事诉讼。
• 风险防范：在诉讼中避免主动承认建筑违章，否则可能承担不利后果；若对方主张建筑违章，可要求其提供行政机关的认定文件。

总结：违章建筑占有权之诉的处理需兼顾行政与民事程序，核心在于明确建筑性质与占有事实。建议根据具体情况选择诉讼路径，并充分准备证据以支持主张。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。