结论前置：当更换法人但股东不同意时，公司应依据公司章程、法律规定及实际情况，通过深入沟通协商、依法召开股东会表决、利用法律途径解决争议等多种方式，依法推进变更事宜。

一、深入了解反对原因并尝试协商解决

1. 沟通了解：首先，与不同意的股东进行深入沟通，明确其反对的具体原因。这可能涉及对公司经营方向的担忧、对新法人能力的质疑，或是担心自身权益受损等。
2. 协商方案：根据反对原因，提出针对性的解决方案。例如，安排新法人与反对股东交流，以消除其疑虑；明确公司经营方向不变，以稳定股东信心；或在股权结构、分红政策等方面做出适当调整，确保股东利益不受损害甚至获得更多潜在收益。

二、严格查阅公司章程并遵循规定

1. 研究章程：仔细研读公司章程中关于法人变更的条款，包括变更条件、程序及所需股东表决权比例等。这是推进变更事宜的基础，也是确保变更合法性的关键。
2. 依章办事：若章程规定变更法人需达到一定比例的股东同意，则在满足该比例的情况下，按照章程规定的程序进行变更。例如，若章程规定需经代表三分之二以上表决权的股东通过，则需确保赞成变更的股东所代表的表决权达到该比例。

三、依法召开股东会进行表决

1. 提前通知：根据公司法和公司章程的规定，提前向全体股东发出召开股东会的通知，明确会议议题、时间、地点和议程。确保所有股东的知情权得到充分保障，以便他们能够充分准备并参与表决。
2. 规范表决：在股东会上，严格按照章程规定的表决程序进行投票。若赞成变更的股东所代表的表决权达到章程规定的比例，则决议通过。此时，不配合的股东需按决议内容履行义务，配合办理变更手续。

四、利用法律途径解决争议

1. 调解优先：若股东间分歧较大，可考虑寻求第三方调解机构或专业人士的帮助，如工商行政管理部门、行业协会或商事调解机构。通过调解，可以尝试在双方都能接受的范围内达成妥协，从而推进变更事宜。
2. 诉讼备选：若调解无果，且变更法人事项符合法律规定和公司章程要求，持有一定比例表决权的股东可向有管辖权的人民法院提起诉讼，请求确认股东会关于变更法人的决议有效。法院将根据公司章程、法律规定以及变更的合理性等进行判断，以确定是否支持变更法人的请求。

五、考虑其他替代方案

1. 股权转让：若股东不想继续担任法人，且无法就变更事宜达成一致，可考虑将股权转让给其他股东或外部人士（需经其他股东过半数同意）。这样，既解决了法人变更的问题，又避免了股东间的直接冲突。
2. 辞职与诉讼：若法人本人不愿意继续担任，可提出辞职。若股东不积极配合选举新法人，法人可提起诉讼要求变更。在此情况下，法人需提供充分的证据证明其已提出辞职，且股东未履行选举新法人的义务。

六、注意事项与后续操作

1. 确保程序合规：在整个过程中，应确保变更程序符合法律法规和公司章程的规定，避免任何违规行为。否则，可能导致变更无效或面临法律责任。
2. 保留相关文件：建议保留好与法人变更相关的各类文件、记录，包括股东会决议、沟通记录、通知函件等。这些文件在后续可能需要的法律程序中具有重要作用。
3. 及时办理手续：一旦变更法人获得批准，应及时办理相关手续，如工商变更登记、税务变更登记等。确保公司运营的连续性和稳定性。
4. 持续沟通：在变更过程中及变更后，保持与不配合股东的沟通，尽可能减少矛盾和冲突。维护公司的和谐稳定对于公司的长期发展至关重要。

总结与建议：面对股东不同意变更法人的情况，公司应秉持合法、合规的原则，通过有效的沟通和协商、依据公司章程和法律规定进行表决、利用法律途径解决争议等多种方式寻求解决方案。在整个过程中，务必确保操作的合法性、合规性和可操作性，以维护公司和股东的合法权益。若遇到复杂情况或难以解决的问题，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律分析和解决方案。