结论前置：
详细分析：
一、违章建筑租赁合同无效的原因
违章建筑，因其违反了《城乡规划法》等相关法律法规的强制性规定，其存在本身就不具有合法性。根据《最高人民法院关于审理城镇房屋租赁合同纠纷案件具体应用法律若干问题的解释》第二条的规定，若出租的房屋未取得建设工程规划许可证或未按该许可证的规定建设，则与承租人订立的租赁合同无效。这是因为，租赁合同是建立在合法有效的租赁物基础之上的，而违章建筑作为租赁物，其标的不具有合法性，所以租赁合同通常会被认定为无效。
二、违章建筑租赁合同有效的例外情况
尽管违章建筑的租赁合同在一般情况下无效，但法律也考虑到了实际情况的复杂性，规定了一个例外情况。即，如果在一审法庭辩论终结前，该违章建筑取得了建设工程规划许可证或得到了主管部门的批准建设，那么人民法院应当认定该租赁合同为有效。这是因为，此时建筑的性质发生了转变，从不合法的违章建筑变为了合法的建筑，满足了租赁合同有效的前提条件。
三、合同无效后的处理原则
当违章建筑的租赁合同被认定为无效后，根据《民法典》的相关规定，因该合同取得的财产应当予以返还；若不能返还或没有必要返还，则应折价补偿。同时，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，则各自承担相应的责任。这意味着，在违章建筑出租合同中，如果合同被认定无效，双方可能需要根据实际情况进行财产的返还、补偿以及损失的赔偿。
四、实际操作建议
在签订租赁合同前，务必核实租赁物的合法性：作为承租人，在签订租赁合同前，应当仔细核实租赁物是否具备合法的建设许可，以确保租赁合同的合法性和有效性。作为出租人，也应当确保所出租的房屋是合法建筑，避免因出租违章建筑而引发法律纠纷。
如遇违章建筑租赁纠纷，及时寻求法律帮助：如果因违章建筑租赁合同引发纠纷，双方应当及时寻求法律帮助，了解自己的权利和义务，以及可能面临的法律后果。在必要时，可以委托专业律师进行代理，以维护自己的合法权益。
五、特殊情形说明
值得注意的是，虽然“买卖不破租赁”原则在合法建筑的租赁中广泛适用，即租赁房屋在租赁期间发生所有权变动时，承租人的租赁权不受影响。但这一原则并不适用于违章建筑的租赁。因为违章建筑本身就不具有合法的产权，所以其租赁权也无法得到法律的保护。
综上所述，违章建筑的租赁合同在一般情况下是无效的，但在特定条件下也可能被认定为有效。在签订租赁合同时，双方务必确保租赁物为合法建筑，以避免因合同无效而引发的一系列法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我咨询。