在处理父子共有房产的法院执行问题时，这是一个涉及法律程序、债务责任、财产分割以及权益保护等多个方面的复杂议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、执行前提与债务责任确认
执行依据：
- 法院执行父子共有的房产，首先必须有合法的执行依据，如判决书、裁定书、调解书等生效法律文书。
- 被执行人需在规定期限内未履行这些法律文书所确定的义务。
债务责任确认：
- 法院在执行前，会确认债务是由谁产生的，以及该债务是否与共有房产有直接关联。
- 如果债务仅由一方（如父亲）产生，且与共有房产无直接关联，执行时应尽量不影响另一方（如儿子）的权益。
二、执行流程与份额确定
查封房屋：
- 法院会向房地产管理部门发出协助执行通知书，对父子共有的房产进行查封登记。
- 查封期间，房产的转让、抵押等处分行为将受到限制。
确定份额：
- 如果房产的产权登记上明确记载了父子各自的份额，那么法院将按照登记份额来确定执行范围。
- 如果产权登记上没有明确记载份额，且房产是基于家庭关系等共同共有的，那么需要先进行析产。析产可以通过父子协商分割，如果协商不成，则可以通过代位诉讼由法院来分割。在分割时，法院会综合考虑出资情况、贡献大小等因素来确定各自的份额。
三、拍卖、变卖与权益保护
进行拍卖、变卖：
- 如果父子双方同意整体处置房产，那么法院可以整体拍卖或变卖房产，并按照各自的份额分配款项。
- 如果父子双方不同意整体处置，且房产可以分割使用，那么法院可以单独拍卖、变卖被执行人的份额。但需要注意的是，这种分割可能会影响房产的整体价值。
保护共有人权益：
- 非被执行人的共有人（如儿子）有权获得属于自己份额的款项。
- 法院在执行过程中，会保障共有人的优先购买权。在同等条件下，共有人有权优先购买房产或被执行人的份额。
四、特殊情况处理
唯一住房：
- 如果该共有房产是父子及其所扶养家属的唯一住房，法院在执行时会特别谨慎。一般不会直接拍卖、变卖房产，但可以进行查封。
- 如果申请执行人能够提供居住房屋或者同意扣除五至八年的租金，那么法院可以考虑对唯一住房进行拍卖、变卖以清偿债务。
未成年人份额：
- 如果儿子是未成年人，法院在执行时会特别慎重，以保护其合法权益。
- 如果有证据证明房产实际是家庭共同财产，且与家庭经营、父母收入有关，那么法院可以考虑执行房产，但必须保障未成年人的居住权益和生活需要。
五、总结与建议
父子共有房产的法院执行问题确实复杂而敏感，需要综合考虑多种因素和法律规定。在实际操作中，我建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。律师可以根据您的具体情况，提供针对性的法律策略，确保执行过程的合法性和公正性，同时最大程度地保护您和家人的合法权益。