医院不让员工停车是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：
若医院有明确的停车管理制度，且该制度合法合理：
- 医院作为用人单位，有权根据自身的经营管理和安全需要，制定合理的停车管理制度。这些制度可能包括停车位的分配、使用时间、使用条件等。
- 如果医院已经通过合法程序（如职工代表大会讨论、公示等）制定了停车管理制度，并且该制度不违反法律法规的强制性规定，不侵犯员工的合法权益，那么医院有权依据该制度管理停车位，包括限制或禁止某些员工停车。
- 例如：医院可能规定，只有特定岗位（如急诊科、手术室等）的员工才能在工作时间停车，或者规定员工停车需要缴纳一定的费用。这些规定如果合法合理，员工应当遵守。
若医院没有明确的停车管理制度，或者制度违法不合理：
- 如果医院没有制定停车管理制度，或者制定的制度违反了法律法规的强制性规定（如歧视性规定、侵犯员工隐私权等），或者侵犯了员工的合法权益（如无故禁止员工停车、收取不合理费用等），那么医院的行为可能构成违法。
- 在这种情况下，员工有权向医院提出异议，要求医院改正违法行为。如果医院不予改正，员工可以向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
- 例如：医院如果无故禁止所有员工停车，且没有提供合理的解释或替代方案，那么这种行为可能构成对员工权益的侵犯。
法律建议：
- 对于员工：如果医院不让员工停车，员工首先应当了解医院的停车管理制度，判断该制度是否合法合理。如果认为制度违法或不合理，可以向医院提出异议，并保留相关证据（如制度文本、通知、沟通记录等）。如果医院不予改正，员工可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 对于医院：医院在制定停车管理制度时，应当遵循合法、合理、公平的原则，充分听取员工的意见和建议，确保制度的合法性和合理性。同时，医院应当加强与员工的沟通，解释制度的目的和意义，减少误解和冲突。
可能法律后果：
- 如果医院的行为被认定为违法，可能需要承担相应的法律责任，如赔偿员工损失、改正违法行为等。
- 如果员工的行为被认定为违反医院制度或法律法规，也可能需要承担相应的责任，如受到纪律处分、承担赔偿责任等。
总之，医院不让员工停车是否合法，取决于医院的停车管理制度是否合法合理。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。