结论：是否有效需分情况讨论，主要取决于诉讼时效、权属争议焦点及证据情况，具体分析如下：

1. 诉讼时效角度
   根据《民法典》第188条，普通诉讼时效为3年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算。但若涉及物权保护（如井的所有权、使用权争议），则不受诉讼时效限制。

   • 若对方主张侵权赔偿（如认为打井行为导致其土地受损）：需在知道损害后3年内起诉，20多年可能已过时效，但若存在持续损害（如井水长期污染土地），时效可能从损害结果确定时起算。
     
   • 若对方主张物权归属（如认为井占用了其土地）：物权请求权不适用诉讼时效，对方可随时主张权利，但需提供权属证明（如土地证、建井审批文件等）。

2. 权属争议焦点

   • 土地使用权：若打井占用的是集体建设用地或宅基地，需确认是否经过村委会或相关部门审批；若占用耕地或他人承包地，可能涉及非法占地，对方可要求恢复原状或赔偿。
     
   • 井的所有权：若井由您家庭出资建造并长期使用，可主张“添附”取得所有权，但需证明建造事实（如证人、材料购买记录等）；若井位于公共区域或他人土地上，所有权可能存疑。

3. 证据关键性

   • 对方需举证：若对方起诉，需提供证据证明其对土地的合法权利（如土地证）及您的侵权行为（如建井时间、位置等）。
     
   • 您的抗辩证据：您可提供建井时间证明（如村委会证明、邻居证言）、长期使用证据（如用水记录、维修记录）及审批文件（如有），以证明合法性或时效已过。

建议：

• 若对方已起诉，尽快收集建井审批文件、土地权属证明、长期使用证据等，并咨询律师制定答辩策略；
  
• 若未起诉但存在争议，可主动与对方协商，明确井的权属及使用范围，必要时通过村委会或司法所调解；
  
• 未来涉及农村建设（如打井、建房），建议提前办理审批手续，避免权属纠纷。
  

如有进一步细节（如建井位置、是否审批、对方主张依据等），可向我补充说明，我会为您具体分析。