结论：集体财产承包合同因承包者违约而作废时，一次性缴纳的承包费能否退回，需根据合同具体条款、违约情形及法律规定综合判断，以下分情况说明：

1. 合同有明确约定时

若承包合同中明确约定了“因承包方违约导致合同解除的，承包费不予退还”或类似条款，则根据《民法典》第五百六十七条（原《合同法》第九十八条），该条款属于双方对违约后果的预先约定，具有法律效力。此时，发包方有权依据合同拒绝退还承包费。

举例：合同约定“承包方逾期支付承包费超30日，发包方有权解除合同且已缴费用不退”。若承包方实际逾期45日，则发包方可依据此条款拒绝退费。

2. 合同无明确约定时

若合同未约定违约后承包费的处理方式，则需根据《民法典》第五百六十六条（原《合同法》第九十七条）分析：

• 发包方实际损失：若承包方违约导致发包方产生实际损失（如土地闲置损失、重新发包成本等），且承包费金额与损失相当，则发包方有权主张用承包费抵扣损失，剩余部分可能需退还。
• 无实际损失或损失较小：若发包方未因违约产生实际损失，或损失明显低于承包费金额，则承包方有权要求退还剩余费用。此时，发包方需举证证明其损失，否则可能被认定为不当得利。

举例：承包方提前终止合同，但发包方已及时将土地转包给他人，未产生实际损失。此时，承包方有权要求退还剩余承包期对应的费用。

3. 违约情节与过错程度

• 重大违约：若承包方存在根本性违约（如擅自转包、破坏集体财产等），法院可能根据公平原则，支持发包方扣除部分或全部承包费作为违约金。
• 轻微违约：若违约情节轻微（如延迟几天支付费用），且未造成实际损失，法院可能酌情减少发包方扣除的金额，甚至判决全额退还。

4. 法律程序与举证责任

若双方无法协商一致，需通过诉讼或仲裁解决：

• 发包方主张不退费：需提供合同、违约证据（如逾期付款记录、破坏财产照片等）及损失证明（如维修费用发票、转包合同等）。
• 承包方主张退费：需证明发包方无实际损失，或违约情节轻微，且合同条款显失公平（如违约金过高）。

建议

1. 审查合同条款：优先核对合同中关于违约责任、费用退还的约定。
2. 评估实际损失：双方均应收集证据证明自身损失或无损失。
3. 协商或诉讼：根据证据充分性选择协商或法律途径，必要时可委托律师介入。

提示：集体财产承包合同涉及集体利益，处理时需兼顾法律与村规民约，建议操作前咨询专业律师以确保合规。如有进一步问题，可直接向我提问。