自己写的协议书，去公证处公证后是有效的，但协议书本身的有效性并不完全依赖于公证。以下从多个角度为你详细分析：
协议书本身的有效性
内容合法性：协议书的内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗。如果协议书内容违法或违背公序良俗，那么即使进行了公证，该协议书也是无效的。例如，协议书中约定了非法交易或侵犯他人权益的内容，这样的协议书自始无效。
意思表示真实性：协议书的双方必须是在自愿、平等、真实的意思表示下签订的。如果一方是在被欺诈、胁迫或重大误解的情况下签订的协议书，那么该协议书可能因意思表示不真实而被撤销或认定无效。
形式要件：虽然大多数协议书并不要求特定的形式，但某些特定类型的协议书，如房地产买卖合同、遗嘱等，可能需要满足特定的形式要件才能生效。如果协议书属于这类特定类型，且未满足形式要件，那么即使进行了公证，也可能因形式不合法而无效。不过，就一般协议书而言，只要内容合法、意思表示真实，即使未进行公证，也是有效的。
公证的作用
增强证明力：公证是由公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。经过公证的协议书，在证据效力上通常更强，更容易被法院或其他机构采信。
预防纠纷：公证过程本身也是对协议书内容的一次审查，可以确保协议书的内容合法、意思表示真实，从而在一定程度上预防后续可能出现的纠纷。
强制执行效力：对于某些特定类型的协议书，如经过公证的债权文书，如果债务人未按照约定履行义务，债权人可以直接向法院申请强制执行，而无需再经过诉讼程序。
实际操作建议
确保协议书内容合法、意思表示真实：在签订协议书前，务必确保协议书的内容符合法律法规的规定，且双方是在自愿、平等、真实的意思表示下签订的。
考虑公证的必要性：虽然公证不是协议书生效的必要条件，但如果你希望增强协议书的证明力、预防纠纷或赋予其强制执行效力，那么可以考虑进行公证。
选择正规公证机构：如果决定进行公证，务必选择正规的公证机构，并按照公证机构的要求提供相关材料和履行相关手续。
总结来说，自己写的协议书去公证处公证后是有效的，但协议书本身的有效性并不完全依赖于公证。在签订协议书时，应确保内容合法、意思表示真实，并根据需要考虑是进行公证。如果你在协议书签订或公证过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询。