在无直接证据证明实际控制人指使法人私刻他人公章进行合同诈骗，但资金用于公司的情况下，判决结果会受到多种因素的影响，无法直接给出确定的判决结论。不过，我可以从法律角度为你分析可能的情况和判决依据：

1. 合同诈骗罪的构成要件：

   • 合同诈骗罪要求行为人具有非法占有为目的，在签订、履行合同过程中，采取虚构事实或者隐瞒真相等欺骗手段，骗取对方当事人的财物，数额较大的行为。
   • 若无法证明实际控制人具有非法占有的目的，或者无法证明其指使法人私刻公章进行诈骗，则难以直接认定其构成合同诈骗罪。

2. 资金用途的影响：

   • 资金用于公司并不直接决定是否构成合同诈骗罪。关键在于资金的使用是否符合合同约定，以及是否存在欺骗手段获取资金。
   • 如果资金确实用于公司正常经营，且没有证据表明实际控制人或法人有非法占有的目的，那么这可能成为减轻或免除刑事责任的一个因素。

3. 证据的充分性：

   • 在刑事案件中，证据的充分性至关重要。若缺乏直接证据证明实际控制人指使法人私刻公章进行诈骗，那么法院可能难以认定其有罪。
   • 间接证据或推定证据需要形成完整的证据链，才能支持有罪判决。

4. 可能的判决结果：

   • 无罪判决：如果证据不足，无法证明实际控制人或法人构成合同诈骗罪，法院可能作出无罪判决。
   • 有罪判决（但情节较轻）：如果法院认为实际控制人或法人存在欺骗行为，但情节较轻，或者资金确实用于公司且未造成严重后果，可能判处较轻的刑罚，如缓刑、罚金等。
   • 其他责任：即使不构成合同诈骗罪，实际控制人或法人也可能因违反公司法、合同法等相关法律法规而承担民事责任或行政责任。

5. 法律建议：

   • 对于此类复杂案件，建议尽快咨询专业律师，以便全面评估案情、收集证据并制定有效的辩护策略。
   • 律师将协助你分析案件的法律要点，包括合同诈骗罪的构成要件、证据的充分性、资金用途的合法性等，并为你提供专业的法律意见。

在处理此类案件时，法院会综合考虑多种因素，包括证据的充分性、行为人的主观意图、资金用途等。因此，无法直接给出确定的判决结论。如果你面临此类法律问题，建议直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供专业的法律分析和建议。