结论：超市使用店内码遮盖商品条码进行销售的行为，其合法性需视具体情况而定，不能一概而论。以下从多个角度进行分析：

1. 从消费者权益保护的角度：

   • 商品条码是商品流通中的重要标识，它包含了商品的生产信息、规格、价格等关键数据，有助于消费者在购买时做出明智的选择。
   • 如果超市使用店内码遮盖商品条码，可能会剥夺消费者获取商品完整信息的权利，从而影响其购买决策。这种行为可能构成对消费者知情权的侵犯，根据《消费者权益保护法》的相关规定，消费者有权了解商品的真实情况，包括其价格、产地、生产者、用途、性能、规格、等级、主要成份、生产日期、有效期限、检验合格证明、使用方法说明书、售后服务，或者服务的内容、规格、费用等有关情况。

2. 从市场竞争和公平交易的角度：

   • 商品条码也是商家进行库存管理、销售统计和价格管理的重要工具。超市使用店内码遮盖商品条码，可能是为了规避某些管理规定或进行不正当的价格竞争。
   • 如果这种行为导致市场秩序混乱，损害了其他商家的合法权益，那么它可能违反了《反不正当竞争法》的相关规定，该法旨在维护市场竞争的公平性和秩序。

3. 从具体行为合法性的角度：

   • 超市使用店内码本身并不违法，但关键在于其使用方式和目的。如果超市是为了方便内部管理而使用店内码，并且确保消费者仍然能够获取到商品的完整信息，那么这种行为可能是合法的。
   • 然而，如果超市使用店内码的目的是为了遮盖商品条码，从而隐瞒商品的真实信息或进行不正当竞争，那么这种行为就是违法的。

法律建议：

• 对于超市而言，应当遵守相关法律法规，确保商品信息的透明度和真实性。如果确实需要使用店内码，应当采取合理的方式，确保消费者仍然能够获取到商品的完整信息。
• 对于消费者而言，如果发现超市使用店内码遮盖商品条码，可以要求超市提供商品的完整信息或向相关部门进行投诉。

可能的法律后果：

• 如果超市的行为被认定为违法，可能会面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
• 同时，如果超市的行为给消费者造成了损失，还可能需要承担民事赔偿责任。

综上所述，超市使用店内码遮盖商品条码进行销售的行为，其合法性需根据具体情况进行判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。