结论前置：关于双方签署合作合同后一方违约，是否必须在三年之内起诉的问题，并非绝对，而是取决于合同中是否约定了诉讼时效或相关条款，以及法律规定的诉讼时效期间。
法律规定的诉讼时效期间：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般的民事诉讼时效期间为三年。这意味着，在大多数情况下，如果一方违约，另一方有权在三年内提起诉讼来维护自己的权益。
- 但是，这并不意味着所有合同纠纷都必须在三年内起诉。如果合同中有特别约定，比如延长或缩短诉讼时效期间，那么应当遵循合同中的约定。
合同中的特别约定：
- 合作合同是双方自愿达成的协议，其中可以包含各种条款，包括诉讼时效的约定。如果合同中明确规定了诉讼时效期间不同于法律规定的三年，那么应当按照合同中的约定来执行。
- 例如，合同中可能约定违约方在违约后的一年内必须被起诉，否则将失去追诉权。这样的约定是有效的，只要它不违反法律的强制性规定。
诉讼时效的中断与延长：
- 在诉讼时效期间内，如果发生了一些特定的事件（如双方协商、一方承认违约等），可能会导致诉讼时效的中断或延长。这意味着，即使原本的三年的诉讼时效期间已经过去，但由于这些特定事件的发生，另一方仍然可能有权提起诉讼。
- 例如，如果违约方在违约后与另一方进行了协商，并承诺在一定时间内解决问题，但最终未能履行承诺，那么这可能导致诉讼时效的中断，并重新开始计算。
实际操作建议：
- 及时咨询：如果发现对方违约，建议尽快咨询专业律师，了解具体的诉讼时效期间和可能的法律后果。
- 保留证据：在诉讼时效期间内，务必保留好所有与合同和违约相关的证据，以便在需要时提供证明。
- 考虑协商：在提起诉讼之前，也可以考虑与对方进行协商，尝试通过和解的方式解决问题，这可能更加高效和经济。
进一步思考：诉讼时效是法律为了保护当事人的合法权益而设定的一项重要制度。它既鼓励当事人及时行使权利，又避免了因时间过长而导致的证据灭失和诉讼困难。因此，在处理合同纠纷时，务必注意诉讼时效的问题，并在必要时及时采取行动来维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。