结论：在征地协议中，若乙方有4户代表但仅3户签字，是否可以付款需分情况讨论，主要取决于协议生效条件、未签字户的授权情况及实际履行情况。

1. 若协议明确约定需全体代表签字生效，则仅3户签字时协议未生效，付款存在法律风险
   根据《民法典》第490条，合同成立需双方意思表示一致。若征地协议中明确约定“本协议自乙方4户代表全部签字后生效”，则仅3户签字时协议尚未成立，付款可能被认定为单方履行，若未签字户事后追认或主张协议无效，已付款项可能面临返还风险。此时建议暂缓付款，待补全签字或通过书面补充协议明确未签字户的授权后再行支付。

2. 若协议未明确约定生效条件，但未签字户已通过行为追认或授权，付款风险较低
   若4户代表中未签字的1户曾通过口头授权、书面委托书或实际领取补偿款等行为表明同意协议内容，可视为对签字行为的追认。根据《民法典》第140条，行为人虽未签字，但以履行义务或接受履行的方式表明接受合同内容的，合同成立。此时付款风险较低，但建议留存未签字户的授权证据（如录音、书面确认函）以备争议。

3. 若未签字户明确反对或未参与协商，付款可能引发纠纷
   若未签字户未参与协议协商过程，且事后明确表示反对（如通过书面声明、诉讼等方式），则已签字的3户可能无法代表全体权益。此时付款可能导致部分补偿款未实际支付给权利人，引发未签字户主张协议无效或要求重新分配补偿款的纠纷。建议优先通过协商补全签字，或由村委会、征地部门出具书面说明，确认未签字户的权益已通过其他方式保障。

实务建议：

• 立即核查征地协议中是否约定生效条件（如签字人数、公证要求等）；
  
• 联系未签字户确认其态度，留存书面或录音证据；
  
• 若无法补全签字，可要求已签字户出具《承诺书》，承诺对未签字户的补偿款承担连带责任；
  
• 付款前建议通过银行转账并备注“征地补偿款”，避免现金支付导致举证困难。
  

如有进一步细节（如协议具体条款、未签字户的参与程度等），可向我补充说明，我会结合具体情形为您分析风险点。