在开车撞死人且负主要责任的情况下，检察院有可能不起诉，但需满足特定条件。以下是对此问题的详细分析：
一、检察院不起诉的主要情形
- 法定不起诉：
- 当行为情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪时，如被害人有重大过错导致事故发生，肇事者行为整体上情节显著轻微；
- 犯罪已过追诉时效期限；
- 经特赦令免除刑罚；
- 依照刑法规定属于告诉才处理的犯罪，且没有告诉或已撤回告诉；
- 犯罪嫌疑人、被告人已死亡；
- 其他法律规定免予追究刑事责任的情况。
在撞死人且负主责的案件中，法定不起诉较为少见，但特殊情况下可能适用。
酌定不起诉（情节轻微不起诉）：
- 若犯罪嫌疑人虽然造成他人死亡且负主要责任，但犯罪情节相对轻微，且悔罪态度良好，如主动自首、立功、与被害人家属达成和解协议并积极赔偿取得谅解等，检察院可以基于社会危害性较低和改造可能性较大的考虑，决定不起诉。
证据不足不起诉：
- 若案件关键证据存在瑕疵，无法确切证明犯罪嫌疑人负主要责任，或对被害人死因的鉴定存在疑问，不能排除其他因素导致死亡结果等情况，致使案件证据达不到确实、充分的起诉标准，检察院应当作出不起诉决定。
二、不起诉决定的后续处理
公安机关复议复核：
- 若公安机关认为不起诉决定有误，可要求复议，意见不被接受时可向上一级人民检察院提请复核。
被害人申诉：
- 被害人若不服不起诉决定，可在收到决定书后七日内向上一级人民检察院申诉，请求提起公诉，或直接向人民法院提起自诉。
被不起诉人申诉：
- 被不起诉人若对决定不服，同样可在收到决定书后七日内向人民检察院申诉。
三、注意事项
谅解书的作用：
- 虽然取得被害人家属的谅解是积极因素，但并非决定性，检察院会全面考量案情后决定是否起诉。
民事赔偿责任：
- 即便检察院决定不起诉，肇事者仍需承担民事赔偿责任，包括医疗费、丧葬费、死亡赔偿金等各项合理费用。
驾驶证处理：
- 根据《道路交通安全法》，发生重大交通事故构成犯罪的，公安机关交通管理部门将吊销机动车驾驶证，且在一定期限内（如二年）不得重新申请。
四、法律建议
积极配合调查：
- 肇事者应积极配合公安机关和检察院的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
真诚悔罪并积极赔偿：
- 肇事者应表现出真诚的悔罪态度，积极与被害人家属协商赔偿事宜，并尽力履行赔偿义务，以争取取得被害人家属的谅解。
寻求专业律师帮助：
- 在处理此类案件时，肇事者应寻求专业律师的帮助，以便更好地了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果，从而制定合适的应对策略。
综上所述，在开车撞死人且负主要责任的情况下，检察院是否起诉需综合考量多种因素。肇事者应积极配合调查，真诚悔罪，积极赔偿并取得谅解，同时寻求专业律师的帮助，以争取最佳的法律结果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。