在行政处罚中，没收违法所得时是否扣除成本，需根据具体案件的性质、情节以及相关法律法规的规定来确定，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、核心原则与计算方法
全部违法所得原则：
- 这一原则强调，行政相对人通过违法行为所获得的全部收入，无论是否扣除成本，都应视为违法所得并予以没收。这体现了对违法行为的严厉制裁，旨在防止违法者从违法行为中获利。
- 例如，在无照经营等行为中，通常将全部收入视为违法所得，不扣除成本。
合理扣除原则：
- 在某些特定情况下，为体现公平和合理性，允许从总收入中扣除与违法行为直接相关的、合理的成本支出。但扣除的成本必须是为实施违法行为而直接支出的费用，且需有明确的依据和标准。
- 例如，在违法生产、销售商品或提供服务的情况下，如果能够证明某些成本是直接用于违法活动的，且这些成本在计算违法所得时应当被合理扣除，那么行政机关在计算违法所得时可能会考虑这些因素。
二、具体计算方法
销售收入法：
- 适用于以销售商品或提供服务等方式获取违法所得的情形。此时，实际销售的收入（扣除退货部分）即为违法所得，一般不扣除成本。
利润计算法：
- 在某些情况下，先计算出因违法行为所产生的利润作为违法所得。这通常涉及用违法活动的全部收入减去合理的成本。但此方法要求成本的扣除必须有合理的依据，且需严格遵循相关法律法规的规定。
- 例如，在《工商行政管理机关行政处罚案件违法所得认定办法》中，就规定了多种违法行为的违法所得计算方式，其中一些就涉及到了成本的扣除问题。
价值计算法：
- 当违法所得难以通过销售收入或利润来计算时，如文物走私等案件，可按照相关物品的价值来确定违法所得。这通常涉及对物品的评估或估价，一般不考虑成本的扣除。
三、考虑因素与实际操作
违法行为的性质：
- 不同性质的违法行为，其违法所得的计算方式可能有所不同。例如，欺诈案件中的违法所得可能是受害者支付的金额，而走私案件则可能是走私物品的价值。
直接相关收入：
- 计算违法所得时，应仅将与违法行为直接相关的收入计入其中。这包括因违法行为而获得的现金、财物或其他形式的经济利益。
证据材料：
- 确保计算的准确性和公正性，必须依据确凿的证据材料。这可能包括财务记录、交易凭证、银行流水等。行政机关在调查取证时，应全面、客观、公正地收集证据，确保证据的真实性和合法性。
法律法规规定：
- 最重要的是，要严格遵守相关法律法规的具体规定。因为不同领域的法律可能对违法所得的计算有不同的要求和标准。例如，在工商行政管理领域，就有专门的规章对违法所得的认定和计算作出了详细规定。
四、实际操作中的建议
- 配合行政机关调查：在行政机关进行调查取证时，当事人应积极配合，提供真实、完整的证据材料，以便行政机关准确计算违法所得。
- 主张合理扣除：如果当事人认为某些成本应当被合理扣除，应在行政机关调查取证时及时提出，并提供相关证据材料支持自己的主张。
- 寻求法律救济：如果当事人对行政机关作出的没收违法所得决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
总结来说，行政处罚中没收违法所得时是否扣除成本，需根据具体案件的性质、情节以及相关法律法规的规定来确定。如果您面临此类问题，建议直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。