民事案件协商好了并不意味着就一定结案了，这取决于协商的具体情况和后续的法律程序。以下从不同角度进行分析：
协商达成和解协议的情况：
- 如果双方当事人在诉讼过程中，通过协商达成了和解协议，并且该协议得到了法院的确认（例如，通过制作调解书的方式），那么该案件通常可以视为结案。因为调解书具有与判决书同等的法律效力，一旦双方签收，即产生法律约束力，一方不履行，另一方可以申请法院强制执行。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果。调解书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。
协商未达成正式和解协议或未经过法院确认的情况：
- 如果双方当事人虽然进行了协商，但并未达成正式的和解协议，或者达成的和解协议并未经过法院的确认（例如，只是私下达成协议，没有制作调解书），那么该案件并不能视为结案。因为私下达成的协议可能缺乏法律约束力，一旦一方反悔或不履行，另一方无法直接依据该协议申请法院强制执行。
- 后续程序：在这种情况下，如果一方希望继续解决纠纷，可能需要重新启动诉讼程序，或者通过其他合法途径（如仲裁、调解等）来寻求解决方案。
协商后撤诉的情况：
- 如果双方当事人在协商后，原告方决定撤诉，并且法院裁定准许撤诉，那么该案件也可以视为结案。因为撤诉是原告方对其诉讼权利的处分，一旦法院裁定准许撤诉，即意味着诉讼程序终结。
- 注意事项：但需要注意的是，撤诉后如果原告方再次就同一事实和理由提起诉讼，可能会受到法律上的限制（如诉讼时效、一事不再理等原则）。
建议：
- 在民事案件中，如果双方当事人希望通过协商解决纠纷，建议尽量在法院的主持下进行调解，并制作调解书，以确保和解协议的法律效力和可执行性。
- 如果私下达成协议，建议咨询专业律师，了解协议的法律效力和可能存在的风险，并在必要时通过法律程序（如申请司法确认）来增强协议的法律约束力。
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