结论：个体工商户用微信发工资本身不违法，但需满足特定条件并注意潜在风险。以下是具体分析：

1. 合法性前提：满足工资支付核心要求
   根据《工资支付暂行规定》，工资支付需满足“货币形式、直接支付、足额支付、定期支付”四项原则。微信转账属于电子支付方式，本质仍是货币支付（通过银行系统完成资金转移），因此不违反法律强制性规定。但需注意：

   • 必须足额支付（不得克扣或拖欠）；
     
   • 需明确支付周期（如按月支付），并在转账备注中注明“工资”及具体月份；
     
   • 若涉及加班费、奖金等，需单独标注金额及性质。

2. 潜在风险与合规建议

   • 税务合规风险：个体工商户需按“经营所得”申报个人所得税，若未通过银行代发工资（如微信转账），可能被税务机关认定为“未履行代扣代缴义务”。建议：保留转账记录、工资表（需员工签字确认），并定期向税务机关申报。
     
   • 劳动争议举证风险：若发生欠薪纠纷，微信转账记录可能因“未体现劳动关系”或“金额不明确”被质疑。建议：签订书面劳动合同，并在转账时备注“XX员工X月工资”，同时要求员工回复确认（如“已收到X月工资XX元”）。
     
   • 支付安全风险：微信转账可能因账户被盗、误转等导致损失。建议：优先使用对公账户转账，若用个人微信，需确保账户安全，并避免与私人资金混用。

3. 特殊情形注意

   • 若个体工商户未与员工签订劳动合同，微信转账可能被认定为“非劳动关系支付”（如劳务报酬），此时需按“劳务报酬所得”代扣代缴个税，税率可能更高。
     
   • 若员工主张“未收到工资”，个体工商户需承担举证责任（如转账记录、员工确认信息等），否则可能面临败诉风险。

总结：微信发工资可行，但需完善证据链（合同、转账备注、确认记录）并履行税务义务。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。