结论：自然人偷税100万且占比100%，即使税务部门5年内未发现免除罚款，仍可能面临刑事责任，是否免除需结合具体情节判断。以下从法律责任类型、追诉时效、免责情形三个角度展开分析：
一、行政责任与刑事责任的区分：罚款免除≠刑事免责
根据《税收征收管理法》第六十三条，偷税行为需承担行政责任（补缴税款、滞纳金、罚款）与刑事责任（逃税罪）双重后果。税务部门未在5年内发现偷税行为，根据该法第八十六条，仅免除行政罚款，但刑事责任不受此限制。
法律依据：
- 《刑法》第二百零一条逃税罪规定，纳税人采取欺骗、隐瞒手段逃避缴纳税款数额较大（10万元以上）且占应纳税额10%以上的，构成犯罪，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
- 偷税100万且占比100%，已远超“数额较大”标准，若未在税务机关下达追缴通知前补缴税款、缴纳滞纳金并接受行政处罚，刑事责任无法免除。
二、刑事追诉时效：5年未发现≠必然免责
刑事追诉时效以“犯罪之日”起算，逃税罪法定最高刑为七年有期徒刑（数额巨大且占应纳税额30%以上），追诉时效为十年。
关键点：
- 若偷税行为发生在5年前，但税务机关在追诉时效内（10年内）发现并移送公安机关，仍可追究刑事责任；
- 若行为人主动投案、如实供述或配合调查，可能构成自首或坦白，从轻或减轻处罚，但不直接免除刑事责任。
三、刑事免责的唯一路径：初犯补缴+行政处罚
根据《刑法》第二百零一条第四款，逃税罪刑事责任可免除的唯一条件是：
- 税务机关依法下达追缴通知后，行为人补缴应纳税款；
- 缴纳滞纳金；
- 已受行政处罚（即使超过5年未被发现，若后续被查处仍需满足此条件）。
例外情形：若行为人五年内因逃避缴纳税款受过刑事处罚或被税务机关给予二次以上行政处罚，则不适用免责条款。
实务建议
- 立即自查补缴：若尚未被税务机关查处，应尽快补缴税款、滞纳金，争取行政处罚从轻；
- 咨询刑事风险：若已进入刑事程序，需结合补缴情况、主观恶性等论证社会危害性降低，争取缓刑或轻判；
- 避免二次违法：逃税行为被查处后，五年内再次逃税将直接构成犯罪，无免责可能。
如有进一步细节（如是否曾受处罚、是否主动补缴等），可继续向我咨询，我会结合具体情节提供更精准的分析。