若医院不配合封存电子病历，可采取以下措施处理：

1. 明确法律依据与医院义务
   根据《医疗纠纷预防和处理条例》第二十三条，发生医疗纠纷后，医疗机构应配合患者或其代理人封存病历资料（包括电子病历）。若医院无正当理由拒绝配合，已涉嫌违反行政法规，患者可据此主张权利。

2. 协商与书面催告

   • 第一步：书面要求
     向医院医务科或医患关系办公室提交书面申请，明确要求封存电子病历，并注明法律依据及医院义务。建议通过EMS邮寄（留存寄送凭证），确保医院签收后无法否认收到申请。
     
   • 第二步：协商沟通
     若医院口头拒绝，可要求其出具书面拒绝理由。若医院以“系统故障”“需审批”等理由拖延，可要求其明确解决时限，并保留沟通记录（录音、聊天记录等）。

3. 向卫生行政部门投诉
   若协商无果，可向医院所在地的县级以上卫生健康主管部门投诉（如卫健委医政科），提交以下材料：

   • 书面投诉信（说明医院不配合的事实及法律依据）；
     
   • 医院拒绝配合的证据（如书面回复、沟通记录）；
     
   • 患者身份证明及与医院关系的证明（如病历、缴费凭证）。
     卫生行政部门有权责令医院改正，并可对其处以警告、罚款等行政处罚。

4. 申请法院证据保全
   若病历封存涉及诉讼（如医疗损害责任纠纷），可向法院申请证据保全，要求医院立即提交电子病历并封存。根据《民事诉讼法》第八十四条，法院可采取查封、扣押、复制等措施固定证据，防止医院篡改或销毁。

5. 注意电子病历的特殊性

   • 封存形式：电子病历需与纸质病历同步封存，或通过“导出、打印后封存”或“系统锁定+第三方存储”等方式固定。
     
   • 完整性验证：封存时要求医院提供电子病历的“哈希值”（唯一数字指纹）或时间戳，确保病历未被篡改。
     
   • 复制权：患者有权要求医院提供电子病历的复制件（如光盘、U盘），医院不得拒绝。

行动建议：

1. 优先通过书面催告+卫生行政部门投诉解决，效率较高；
   
2. 若涉及诉讼，立即申请证据保全，避免证据灭失；
   
3. 全程保留沟通记录、投诉材料等证据，以备后续维权使用。
   

如有进一步细节（如医院具体拒绝理由、是否已发生纠纷等），可向我补充说明，以便提供更精准的方案。