更换后的旧土地承包证应当交回原发证机关进行统一处理，通常会被注销并归档保存，个人不得私自留存或销毁。以下是详细说明：
交回原发证机关：根据《中华人民共和国农村土地承包法》及相关规定，当土地承包经营权证因各种原因（如承包地变更、证书损毁等）需要更换时，旧的土地承包证应当交回原发证机关，即县级以上地方人民政府。这是为了确保证书管理的规范性和法律效力的连续性。
注销与归档：原发证机关在收到旧证后，会进行注销处理，并在相关系统中更新信息，确保旧证不再具有法律效力。同时，为了后续管理和查询的需要，旧证通常会被归档保存一段时间。
不得私自留存或销毁：个人不得私自留存旧土地承包证，因为这可能导致证书被滥用或产生不必要的法律纠纷。同样，个人也不得擅自销毁旧证，因为这可能违反相关法律法规，并影响后续的土地承包经营权管理。
特殊情况处理：
如果旧证遗失：在更换新证的过程中，如果旧证不慎遗失，应当立即向原发证机关报告，并按照其要求进行补办或声明作废等手续。
如果涉及土地承包经营权变更：在土地承包经营权发生变更（如转让、互换等）时，除了需要更换新的土地承包证外，还需要依法办理相关的变更登记手续，以确保新的证书能够准确反映当前的土地承包经营权状况。