在施工中发现文物，施工单位可以依法索赔以下费用：
停工损失费用：
- 工期延误损失：因文物发掘导致的停工，施工单位有权要求赔偿因此产生的租赁设备停滞费用和人员窝工费用。这些费用应基于实际发生的租赁费用和工资支出进行计算，并提供相应的证据支持，如租赁合同、工资单等。
- 示例：若施工单位因停工导致某台大型设备闲置了10天，每天租赁费用为5000元，则可索赔50000元的设备停滞费用；同时，若停工期间有20名工人处于窝工状态，每人每天工资为300元，则可索赔60000元的人员窝工费用。
额外的管理费用：
- 包括停工期间的现场管理费用增加，如安保、临时设施维护等，以及与文物部门沟通协调所产生的费用，如差旅费、会议费等。这些费用同样需要提供详细的记录和凭证来支持索赔。
后续恢复施工的费用：
- 停工后重新恢复施工所需的复工准备费用，如设备调试费、场地清理费等，以及为赶工期而增加的施工人员和设备等费用，均可作为索赔内容。但需要注意的是，这些费用的合理性需经过评估，并与相关部门协商确定。
- 示例：若复工准备费用为20000元，且为赶工期增加了10名工人和2台设备，额外费用为50000元，则可索赔70000元的后续恢复施工费用。
对已完成工程部分的损害修复费用：
- 如果文物勘查、发掘过程中对已完成的部分工程造成了损坏，施工单位有权要求赔偿修复费用。这包括材料费用、人工费用等，并需要提供修复方案和费用明细作为索赔依据。
- 示例：若文物发掘导致已完成的某段墙体损坏，修复需要材料费用10000元，人工费用5000元，则可索赔15000元的损害修复费用。
索赔的实现条件与程序：
- 施工单位要实现索赔，必须具备完善的施工记录、与文物部门沟通的文件等证据来支持其主张。这些证据应详细、准确，并能够证明索赔费用的合理性和必要性。
- 索赔应按照合同约定和相关法律规定的程序进行。首先，施工单位应及时与文物部门沟通，了解文物发掘的进度和可能的影响；其次，施工单位应向建设单位或相关责任方提交索赔申请，并提供必要的证据材料；最后，双方应协商确定索赔金额和支付方式。
法律责任与风险：
- 施工单位在施工中发现文物后，应立即停止施工，保护现场，并及时通知文物部门进行处理。这是施工单位的法定义务，也是确保文物安全的重要措施。如果施工单位因施工活动意外损坏了文物或未按规定及时上报文物发现，可能会面临赔偿责任甚至更严重的法律制裁。
- 因此，施工单位应严格遵守相关法律法规，积极履行法定义务，以确保自身合法权益不受损害。同时，在索赔过程中，施工单位也应保持诚信和合作态度，与相关部门积极沟通协商，共同推动问题的解决。
总结与建议：
在施工中发现文物时，施工单位应积极履行上报义务，并配合文物部门的工作。同时，对于因文物发掘而导致的经济损失，施工单位可以在提供证据的基础上，依法向相关部门提出索赔请求。但需要注意的是，索赔的实现需遵循一定的程序和法律规定，且施工单位应时刻牢记文物保护的法律责任与风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。