质保金的计算是否包含变更费用，需根据合同约定及项目具体情况综合判断，常见情形如下：

1. 合同明确约定变更费用纳入质保金计算范围
   若合同中明确约定“质保金按合同总价（含变更费用）的X%计提”，或单独约定“变更部分价款需同步计提质保金”，则变更费用必然纳入计算基数。例如：某建设工程合同约定“质保金为结算总价的5%，结算总价包含设计变更、签证等费用”，此时变更费用需计入质保金。

2. 合同未明确约定，但变更属于合同范围调整
   若变更属于合同内正常调整（如设计优化、工程量增减），且合同未排除此类费用，通常应纳入质保金计算。例如：施工合同约定“质保金按实际完成工程价款的3%计提”，而变更部分属于实际完成工程的一部分，则需计入。

3. 合同明确排除变更费用或约定特殊计算方式
   若合同约定“质保金仅按合同原价（不含变更）计提”，或“变更费用单独按X%计提质保金”，则变更费用不纳入原质保金基数，或按独立比例计提。例如：某采购合同约定“设备价款质保金为5%，安装调试变更费用质保金为2%”，此时需分项计算。

4. 变更属于新增项目或独立合同范围
   若变更内容超出原合同范围（如新增设备、扩大规模），且双方签订补充协议明确“新增部分不纳入原合同质保金范围”，则变更费用不计入。但需注意：若补充协议未明确排除，可能被推定为需计入。

实务建议：

• 审查合同条款时，重点关注“质保金计算基数”“变更费用处理”等条款，避免模糊表述；
  
• 若合同未约定，建议双方通过补充协议明确变更费用是否纳入质保金，减少争议；
  
• 发生争议时，可结合合同目的、行业惯例（如建设工程领域通常将变更纳入质保金）及公平原则主张权利。
  

如有具体合同或项目情况，可进一步向我咨询，我会结合条款细节为您分析。