结论：第二次起诉离婚时，即便有分居证明，也不能保证法院一定会判决离婚。关键在于分居证明能否充分证明夫妻感情确已破裂，并且符合《中华人民共和国民法典》中规定的离婚条件。
法律分析：
分居证明的作用：
- 分居证明，如租房合同、居委会或物业的居住证明等，可以作为夫妻因感情不和而分居的证据。根据《民法典》的规定，因感情不和分居满二年，是法院应当准予离婚的情形之一。但分居证明本身并不直接决定离婚结果，它只是证明夫妻感情破裂的一个可能因素。
法院的综合判断：
- 法院在审理离婚案件时，会综合考虑多个方面，包括婚姻基础、婚后感情、离婚原因、夫妻关系的现状和有无和好的可能等。分居证明只是其中的一部分证据，法院还会结合其他证据和事实，如双方是否有过沟通、是否尝试过修复关系、是否存在其他导致感情破裂的情形等，来作出综合判断。
其他可能导致离婚的情形：
- 除了因感情不和分居满二年外，《民法典》还规定了其他几种应当准予离婚的情形，如重婚或与他人同居、实施家庭暴力或虐待遗弃家庭成员、有赌博吸毒等恶习屡教不改等。如果分居证明不能充分证明感情破裂，但存在其他这些情形，且能提供相应证据，法院也可能判决离婚。
第二次起诉离婚的特殊性：
- 第一次起诉离婚未获准许后，如果双方关系未改善，原告再次起诉，往往能体现双方感情未有好转。此时，法院判决离婚的概率会增加，但并非绝对。法院仍然会综合考虑具体案情及证据来判断夫妻感情是否确已破裂。
建议：
- 收集全面证据：除了分居证明外，还应尽可能收集其他能够证明夫妻感情破裂的证据，如聊天记录、通话录音、证人证言等。
- 了解法律程序：熟悉离婚诉讼的法律程序和要求，确保在诉讼过程中不遗漏任何重要环节。
- 保持冷静理性：离婚诉讼可能涉及复杂的情感和利益纠葛，但保持冷静理性有助于更好地维护自己的权益。
示例说明：
假设一对夫妻因感情不和分居已满一年，但未满二年。男方第二次起诉离婚，并提供了租房合同作为分居证明。然而，如果女方能够证明双方在分居期间仍有沟通，且男方存在过错（如赌博、吸毒等恶习），但并未达到屡教不改的程度，法院可能会认为夫妻感情尚未完全破裂，从而判决不准离婚。因此，分居证明虽然重要，但并非决定性因素。
总之，第二次起诉离婚时，分居证明只是证明夫妻感情破裂的一个可能因素。要成功离婚，还需要结合其他证据和事实，以及法院的综合判断。如果你正面临这样的法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议。