网约车作为营运车辆在事故中负全责时，保险是否赔付营运损失需分情况讨论，具体分析如下：

1. 交强险的赔付范围
   根据《机动车交通事故责任强制保险条例》及《交强险条款》，交强险的财产损失赔偿限额为2000元，且仅赔偿直接财产损失（如车辆维修费用）。营运损失属于间接损失，交强险不赔付。

2. 商业三者险的赔付范围
   商业三者险的赔付需以保险合同约定为准。若合同中明确约定“停运损失、误工费等间接损失不赔”，则保险公司可拒赔；若合同未明确排除或条款存在歧义，根据《保险法》第17条（格式条款提示说明义务），保险公司可能需承担赔付责任。
   实务中，多数商业三者险条款会通过加粗、加黑等方式明确排除间接损失，因此保险公司拒赔的概率较高。

3. 司机或网约车平台的责任
   若保险拒赔，营运损失需由侵权方（即全责方）自行承担。此时需区分责任主体：

   • 若司机与平台为劳动关系，平台作为用人单位需承担赔偿责任；
     
   • 若司机与平台为合作关系（如挂靠），则司机需自行承担，但平台可能因管理过错承担补充责任。

4. 索赔依据与流程
   受害方需提供以下证据证明营运损失：

   • 网约车运营资质证明（如《网络预约出租汽车运输证》）；
     
   • 事故前3-6个月的收入流水（需扣除成本后计算纯利润）；
     
   • 维修厂出具的维修时间证明或交警部门的事故处理时间证明。
     索赔流程：先向全责方提出主张，若协商不成可起诉至法院，同时将保险公司列为被告（若涉及商业险赔付争议）。

建议：网约车司机应优先购买包含“停运损失险”的商业险，或在签订保险合同时要求保险公司明确说明间接损失的免责条款。若已发生事故，建议立即固定收入证据并咨询律师，通过法律途径主张权益。