房屋备案合同更名后，买卖双方之间的房款处理需根据更名原因及双方约定分情况处理，具体如下：

1. 因买卖双方协商一致更名
   若更名是双方自愿协商的结果（如原买方转让购房资格），房款处理需以书面协议为准：

   • 已支付房款：若原买方已支付部分或全部房款，需在更名协议中明确约定剩余房款的支付主体（新买方或原买方）、支付时间及方式。例如，新买方直接向卖方支付剩余房款，或原买方与新买方结算后由新买方补足差额。
     
   • 违约责任：若更名后新买方或原买方未按约定支付房款，卖方可依据合同约定要求违约方承担违约责任（如支付违约金、解除合同并赔偿损失等）。
     

2. 因卖方原因更名（如一房二卖）
   若卖方擅自将已备案合同更名至第三方，可能构成违约或欺诈：

   • 原买方权利：原买方可要求卖方继续履行原合同（如过户房屋），或解除合同并要求卖方返还已付房款、赔偿损失（如房屋涨价差价、维权成本等）。
     
   • 新买方风险：若新买方明知卖方“一房二卖”仍购买，可能无法取得房屋所有权，需通过诉讼要求卖方承担缔约过失责任或返还房款。
     

3. 因政策或不可抗力更名（如限购、离婚）
   若更名是因政策调整（如买方丧失购房资格）或不可抗力（如离婚分割财产），房款处理需结合具体原因：

   • 政策原因：若买方因限购无法继续履行合同，双方可协商解除合同并退还房款，卖方需扣除合理费用（如已产生的税费、中介费等）；若卖方拒绝退还，买方可起诉要求返还并主张利息。
     
   • 离婚分割：若更名是因夫妻离婚后房屋归属变更，房款已支付部分通常视为夫妻共同财产分割，剩余房款由新买方（即房屋受让方）继续支付。
     

关键提醒：

• 无论何种原因更名，必须签订书面协议，明确房款支付、违约责任等条款，避免口头约定导致举证困难。
  
• 若涉及第三方（如新买方），建议三方共同签署协议，确保权利义务清晰。
  
• 若更名后卖方拒不配合过户或新买方拒付房款，可凭备案合同、更名协议等证据向法院起诉，要求继续履行或解除合同并赔偿损失。
  

如有具体纠纷或协议条款需要分析，可直接向我咨询，我会结合细节提供进一步建议。