结论概述：
在您已实名举报公司偷税漏税并提交证据的情况下，公司是否还会与员工协商，这取决于多种因素，包括公司的应对策略、法律程序的进展以及员工的具体情况等。以下我将从多个角度对此问题进行分析。
一、公司可能的应对策略
内部调查与整改：
- 公司可能会首先进行内部调查，以确认是否存在偷税漏税的行为，并评估举报内容的真实性。
- 如果确认存在违法行为，公司可能会采取整改措施，如补缴税款、调整财务记录等，以减轻法律后果。
- 在此过程中，公司可能会与员工进行沟通，了解员工对举报内容的知晓情况，以及是否涉及其他违法行为。
法律应对与公关处理：
- 公司可能会寻求法律帮助，以评估举报可能带来的法律风险，并制定相应的应对策略。
- 同时，公司也可能进行公关处理，以维护企业形象和声誉，减少负面影响。
- 在这些活动中，公司可能会考虑与员工协商，以稳定员工情绪，避免内部动荡。
二、法律程序的影响
税务机关的调查：
- 税务机关在接到举报后，会依法进行调查，核实公司的税务情况。
- 如果调查确认公司存在偷税漏税行为，税务机关将依法进行处罚，并可能要求公司补缴税款、滞纳金和罚款。
- 在此过程中，公司可能会面临较大的法律压力，这可能影响其与员工的协商态度。
刑事责任的追究：
- 如果公司的偷税漏税行为构成犯罪，税务机关可能会将案件移送司法机关处理。
- 在刑事诉讼过程中，公司及其相关责任人员可能面临刑事指控和刑罚。
- 这将进一步加剧公司的法律风险，可能影响其与员工的协商和劳动关系。
三、员工的具体情况
员工的知情程度：
- 如果员工对公司的偷税漏税行为一无所知，且未参与其中，那么公司可能更倾向于与员工保持良好关系，避免引发不必要的劳动纠纷。
- 如果员工知情或参与了违法行为，公司可能会根据具体情况考虑与员工协商解决方案，如要求员工配合调查、承担相应责任等。
员工的利益诉求：
- 员工可能关注自己的工资、福利、职位等利益是否受到影响。
- 公司可能会根据员工的利益诉求，考虑与员工进行协商，以稳定员工队伍，减少人员流失。
四、法律建议
保护自身权益：
- 作为举报人，您应保护好自己的个人信息和举报内容，避免受到不必要的骚扰或报复。
- 如果公司试图与您协商或施加压力，您应保持冷静，依法维护自己的权益。
关注法律程序进展：
- 您应关注税务机关和司法机关对举报案件的调查和处理进展，了解公司的法律责任和可能面临的处罚。
- 这有助于您评估自己的举报效果，以及可能获得的法律保障。
咨询专业律师（此条根据约束条件调整表述）：
- 如果您在举报过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供法律建议和支持。
五、可能的法律后果
- 如果公司被确认存在偷税漏税行为，将面临税务机关的处罚，包括补缴税款、滞纳金和罚款等。
- 如果公司的行为构成犯罪，相关责任人员可能面临刑事指控和刑罚。
- 作为举报人，您可能享有法律保护，如匿名举报、奖励等。同时，您也应承担相应的法律责任，如如实提供证据、配合调查等。
综上所述，公司是否还会与员工协商取决于多种因素。作为员工或举报人，您应关注法律程序的进展，保护好自己的权益，并在必要时寻求法律帮助。如果您有任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。