结论：产权证明书上同时盖有村委会和乡政府的公章，其合法性需分情况讨论，不能一概而论。以下是对此问题的详细分析：
合法且具有证明效力的情况
符合地方政策或习惯做法：
- 在某些地区，由于历史原因或地方政策，村委会和乡政府在房屋产权证明上盖章是一种习惯做法，用于确认房屋的基本事实或产权归属。
- 在这种情况下，如果这种做法得到了当地政府或相关部门的认可，并且没有违反法律法规的强制性规定，那么这样的产权证明书在当地是具有证明效力的。
农村集体内部事务：
- 在处理农村集体内部的宅基地分配、房屋产权流转等事务时，村委会和乡政府作为基层管理组织，其盖章的产权证明书在集体内部具有一定的权威性。
- 例如，在宅基地调整或房屋买卖时，如果双方都是本集体经济组织的成员，且交易符合当地政策，那么村委会和乡政府盖章的产权证明书可以作为交易的有效凭证。
不合法或证明效力受限的情况
违反法律法规的强制性规定：
- 如果产权证明书的出具违反了《民法典》中关于不动产登记的相关规定，或者与当地政府关于房屋产权管理的政策相悖，那么这样的产权证明书是不合法的。
- 例如，如果房屋产权应当通过不动产登记机构进行登记，而村委会和乡政府却擅自出具产权证明书，这样的证明书在法律上是不被认可的。
涉及重大产权交易或法律纠纷：
- 在房屋买卖、抵押、继承等重大产权交易或涉及法律纠纷时，仅凭村委会和乡政府盖章的产权证明书是不足够的。
- 在这些情况下，法院或其他相关机构更看重的是不动产登记等法定的产权凭证。如果产权证明书与不动产登记证书不一致，或者无法提供不动产登记证书，那么产权证明书的证明力将受到严重限制。
外部交易中的局限性：
- 在与村集体之外的主体进行交易时，村委会和乡政府盖章的产权证明书的证明力也相对有限。
- 外部交易主体可能更看重的是房屋的法定产权凭证和交易的安全性，因此，仅凭村委会和乡政府的盖章可能无法获得外部交易主体的信任。
法律建议
优先办理法定产权证书：
- 为了确保房屋产权的合法性和安全性，建议优先办理法定的不动产权证书。
- 不动产权证书是房屋产权的法定凭证，具有最高的法律效力，可以避免因产权证明书不合法或证明效力受限而带来的风险。
咨询当地政府或相关部门：
- 如果对产权证明书的合法性或证明效力有疑问，建议咨询当地政府或相关部门，了解当地政策或习惯做法。
- 这样可以更准确地判断产权证明书的合法性和证明效力，避免因不了解当地政策而带来的风险。
在交易或纠纷中谨慎使用：
- 在涉及房屋买卖、抵押、继承等重大产权交易或法律纠纷时，应谨慎使用村委会和乡政府盖章的产权证明书。
- 在这些情况下，建议寻求专业法律人士的帮助，确保交易或纠纷的合法性和安全性。
总结：产权证明书上同时盖有村委会和乡政府的公章，其合法性需根据具体情况来判断。在涉及重大产权交易或法律纠纷时，应优先考虑使用法定的产权凭证，并咨询专业法律人士以确保合法权益得到保障。如果你有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。