结论：在高速行驶撞到野生动物的情况下，一般不可以直接申请“代为追查”野生动物的责任方或相关管理机构，但可以根据具体情况追究相关责任或申请赔偿，具体需结合事故发生的具体情境和法律规定来分析。
一、野生动物本身不承担法律责任
首先，需要明确的是，野生动物作为自然界的生物，不具备法律上的主体资格，因此无法承担法律责任。所以，从直接追查野生动物责任的角度来看，这一申请是不成立的。
二、可能涉及的责任方及追责途径
道路管理部门：
- 如果事故是由于道路设计、维护或管理上的缺陷导致的，例如道路标志不清、护栏损坏等，使得野生动物能够轻易进入高速公路，从而引发事故，那么道路管理部门可能需要承担一定的责任。
- 在这种情况下，你可以向道路管理部门提出索赔申请，要求其赔偿因事故造成的损失。但需要注意的是，这通常需要证明道路管理部门的过错与事故之间存在直接的因果关系。
野生动物保护机构或相关部门：
- 在某些情况下，如果野生动物保护机构或相关部门未能履行其职责，如未及时采取措施防止野生动物进入高速公路等，也可能需要承担一定的责任。
- 然而，这种情况下的责任追究通常比较复杂，需要详细的调查和证据支持。而且，即使能够证明相关部门的过错，其赔偿范围也可能受到限制。
三、保险理赔途径
车辆保险：
- 如果你购买了车辆保险，特别是包含碰撞险或全险的保险，那么你可以向保险公司提出理赔申请。
- 保险公司会根据保险合同的约定，对你的车辆损失进行赔偿。但需要注意的是，保险公司可能会要求你提供相关的事故证明和损失评估报告。
野生动物损害保险（如存在）：
- 在某些地区或针对特定情况，可能存在专门的野生动物损害保险。如果你购买了此类保险，那么你可以根据保险合同的约定向保险公司提出理赔申请。
四、实际操作建议
立即报警并保留证据：
- 在发生事故后，应立即报警并保留好相关证据，如事故现场照片、视频、警方报告等。这些证据将有助于你后续追究责任或申请赔偿。
咨询专业律师：
- 由于涉及野生动物的事故可能比较复杂，且不同地区的法律规定可能存在差异，因此建议你咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。我可以为你提供经济纠纷、侵权纠纷、合同纠纷领域的专业法律咨询，你可以直接向我提问。
了解当地法律规定：
- 不同地区对于野生动物事故的处理方式可能存在差异。因此，在采取行动之前，建议你先了解当地的相关法律规定和政策。