在政府采购委托代理协议中，并非必须明确约定采购方式，但约定采购方式有助于明确双方权利义务、减少争议，因此建议尽量约定。以下从不同角度进行分析：
法律层面分析
法定要求：根据《中华人民共和国政府采购法》及相关规定，政府采购方式包括公开招标、邀请招标、竞争性谈判、单一来源采购、询价等。然而，这些法律并未明确规定政府采购委托代理协议中必须约定具体的采购方式。这意味着，从法律条文的角度来看，协议中不约定采购方式并不直接违反法律规定。
合同自由原则：在合同法律关系中，双方当事人享有合同自由原则，即有权自主决定合同的内容。因此，在政府采购委托代理协议中，双方可以自主决定是否约定采购方式。如果双方认为在协议中不约定采购方式更符合其利益或实际情况，那么这种做法在法律上是可行的。
实际操作层面分析
明确双方权利义务：尽管法律未明确要求约定采购方式，但在实际操作中，约定采购方式有助于明确双方的权利义务。例如，如果约定采用公开招标方式，那么采购人需要按照公开招标的程序进行采购，代理机构则需要协助采购人完成招标文件的编制、发布招标公告、组织开标评标等工作。这样，双方的权利义务就更加清晰明确，有助于减少争议和纠纷。
提高采购效率：约定采购方式还可以提高采购效率。如果双方在协议中明确约定了采购方式，那么在采购过程中就可以直接按照约定的方式进行操作，无需再就采购方式进行协商和确定。这样可以节省时间和精力，提高采购效率。
风险防控：从风险防控的角度来看，约定采购方式也有助于降低风险。不同的采购方式具有不同的特点和风险点。例如，公开招标方式虽然透明度高、竞争性强，但也可能存在流标、围标等风险；而单一来源采购方式虽然简便快捷，但也可能存在价格虚高、质量不高等风险。因此，在协议中约定采购方式有助于双方更好地了解和控制风险。
建议与总结
建议：尽管法律未明确要求政府采购委托代理协议中必须约定采购方式，但考虑到明确双方权利义务、提高采购效率以及风险防控等因素，建议双方在协议中尽量约定具体的采购方式。如果确实无法在协议中约定采购方式，那么双方可以在采购过程中根据实际情况进行协商和确定，并确保采购过程符合相关法律法规的规定。
总结：政府采购委托代理协议中并非必须约定采购方式，但约定采购方式有助于明确双方权利义务、减少争议并提高采购效率。因此，在实际操作中，建议双方尽量在协议中约定具体的采购方式。如果遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。