当信息公开与档案馆发生冲突时，核心处理原则是依据法律法规，在保障公民知情权与保护档案安全、隐私等合法权益之间寻求平衡，具体处理方式需分情况讨论：
- 冲突源于档案馆以保密为由拒绝公开信息
- 法律依据与原则：根据《中华人民共和国政府信息公开条例》，行政机关应当及时、准确地公开政府信息，除涉及国家秘密、商业秘密、个人隐私等依法应保密的内容外。档案馆作为信息保存和提供利用的机构，同样需遵循这一原则。若档案馆以保密为由拒绝公开信息，需审查该信息是否确实属于法定保密范畴。
- 处理方式：公民或组织认为档案馆拒绝公开的信息不属于保密范围，可先与档案馆沟通协商，要求其说明拒绝公开的具体理由和法律依据。若协商无果，可向档案馆的上级主管部门或同级政府信息公开工作主管部门提出申诉，请求其介入调查并作出处理。此外，公民或组织还可依法提起行政诉讼，通过司法途径解决争议。
- 冲突源于信息公开可能损害档案安全或隐私
- 法律依据与原则：档案的安全和隐私保护是档案管理的重要原则。若信息公开可能对档案实体安全造成威胁，或泄露个人隐私、商业秘密等，档案馆有权拒绝公开。但这一拒绝需有充分的法律依据和合理的理由。
- 处理方式：档案馆在拒绝公开信息时，应向申请人详细说明拒绝的理由和依据，并提供可能的替代方案，如提供部分信息、对敏感信息进行脱敏处理等。若申请人对档案馆的决定不满，可要求档案馆进行内部复核，或向上级主管部门提出申诉。在涉及隐私或商业秘密的情况下，档案馆还需考虑是否可通过与申请人签订保密协议等方式，在保障信息安全的前提下满足其信息需求。
- 冲突源于信息公开程序或方式不当
- 法律依据与原则：信息公开需遵循法定程序和方式，确保信息的准确性和及时性。若档案馆在信息公开过程中存在程序瑕疵或方式不当，可能引发与申请人的冲突。
- 处理方式：档案馆应加强信息公开的规范化管理，完善信息公开流程，确保信息的准确性和及时性。若因程序或方式问题引发冲突，档案馆应主动与申请人沟通，解释情况并纠正错误。若申请人对档案馆的处理方式不满，可向档案馆的上级主管部门或政府信息公开工作主管部门反映情况，请求其督促档案馆改进工作。