员工休超年假是否合法，需根据具体情况来判断，核心在于是否符合法律法规的规定以及公司的年休假安排政策。以下是对此问题的详细分析：
合法情形
公司统一安排且征得员工同意：
- 根据《企业职工带薪年休假实施办法》第九条，用人单位应考虑职工本人意愿，统筹安排年休假。若公司因业务淡季、设备维护等原因需要统一放假，并提前与员工沟通，征得员工书面同意后，将放假时间用年休假来抵充，这种做法是合法的。
- 例子：公司业务淡季需要统一放假一周，提前召开员工大会说明情况，并获得员工同意后实施，此做法符合法律规定。
员工主动申请且公司批准：
- 员工在符合年休假条件的情况下，主动向公司申请休超年假，且公司根据实际情况批准了员工的申请，这也是合法的。
- 例子：员工因个人原因需要额外休息一段时间，向公司提出休超年假的申请，公司根据工作安排和员工表现批准了申请。
符合年休假天数规定且合理安排：
- 员工累计工作满1年不满10年，年休假5天；已满10年不满20年，年休假10天；已满20年，年休假15天。若员工休超的年假天数在其应享受的年休假天数范围内，且公司合理安排了年休假时间，这也是合法的。
- 例子：员工全年应享受年休假10天，已休5天，剩余5天中员工申请休3天超年假，公司根据工作安排批准了申请。
不合法情形
未协商强行安排：
- 如果公司未与员工进行任何协商，单方面决定将放假时间用年休假来冲抵，且员工没有表达意见的机会，这违反了“考虑职工本人意愿”的规定，属于不合法行为。
- 例子：公司突然通知员工放假一周，并直接告知算作年休假，员工没有表达意见的机会，这种做法侵犯了员工对年休假的自主安排权。
年休假天数不足仍强制使用：
- 当员工的年休假已经休完或剩余天数少于公司安排的放假天数时，公司仍强行用年休假来抵充放假时间，这也是不合法的。
- 例子：员工全年年休假为5天，已休5天，但公司却安排其放假一周并全部按年休假处理，这超出了员工应享受的年休假范围，损害了员工的合法权益。
违反法律法规或劳动合同约定：
- 若公司安排员工休超年假的行为违反了相关法律法规或劳动合同的约定，如未支付应休未休年休假的工资报酬等，这也是不合法的。
法律建议
对于公司：
- 在安排员工休超年假时，应提前与员工沟通并征得其同意，确保年休假的安排合理且符合相关法律法规的规定。
- 若因工作需要不能安排员工休年休假或跨年度安排年休假的，应征得职工本人同意，并对职工应休未休的年休假天数按照日工资收入的300%支付年休假工资报酬。
对于员工：
- 应了解自己的年休假权益，包括年休假天数、安排原则等。
- 若遇公司未协商强行安排休超年假、年休假天数不足仍强制使用等不合法情况，可及时与公司沟通协商或向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁以维护自己的权益。
总结来说，员工休超年假的合法性取决于是否符合法律法规的规定以及公司的年休假安排政策。为确保操作的合法性，公司应提前与员工沟通并征得其同意，合理安排年休假时间；员工也应了解自己的年休假权益，如遇不合法情况可及时采取措施维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。