在第三次起诉离婚时，分居的起算点通常是从首次判决不准离婚后，双方继续分居且感情未改善的时间开始计算，而非从上一次判决时间开始计算，但具体还需结合实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、法律原则与规定

根据《民法典》的相关规定，因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。这里的“分居”是指夫妻双方因感情不和而分开居住，且互不履行夫妻义务。在司法实践中，法院在判断分居时间时，通常会从首次判决不准离婚后，双方继续分居且感情未改善的时间开始计算。这是因为，首次判决不准离婚后，如果双方仍然分居且感情没有改善，这更能说明双方感情确已破裂，符合离婚的法定条件。

二、实际操作与判断

1. 首次判决后的分居情况：

   • 如果在首次判决不准离婚后，双方继续分居，并且没有和好的迹象，那么分居时间应从首次判决后开始计算。
   • 例如，首次判决是在2022年1月1日，判决后双方继续分居，那么到2024年1月1日，如果双方仍然分居且感情未改善，就满足了因感情不和分居满二年的条件。

2. 上一次判决后的分居情况：

   • 如果在首次判决后，双方有过短暂的同居或者感情有所改善，但之后又因为感情不和而分居，那么分居时间可能不能简单地从上一次判决后开始计算。
   • 法院在判断时，会综合考虑双方的分居时间、感情状况、是否有和好的可能等因素。

3. 证据的收集与呈现：

   • 在起诉离婚时，你需要提供充分的证据来证明双方因感情不和而分居满二年。这些证据可以包括租房合同、水电费缴纳记录、邻居的证言等。
   • 同时，你还需要提供证据证明在分居期间，双方没有履行夫妻义务，如没有共同生活、没有经济往来等。

三、特殊情况与注意事项

1. 分居期间的联系：

   • 如果在分居期间，双方有过偶尔的联系或者共同活动，这并不一定影响分居时间的计算。关键在于双方是否仍然保持夫妻关系的实质，即是否互不履行夫妻义务。

2. 法院的自由裁量权：

   • 法院在判断分居时间时，会根据具体情况行使自由裁量权。因此，即使你提供了充分的证据，法院也可能根据案件的具体情况做出不同的判断。

3. 多次起诉离婚的策略：

   • 如果你已经多次起诉离婚，但法院仍未判决离婚，你可以考虑在起诉时提供更充分的证据来证明双方感情确已破裂，或者寻求专业的法律帮助来制定更有效的诉讼策略。

建议：在准备第三次起诉离婚时，你应详细梳理双方的分居情况，收集充分的证据来证明分居时间和感情状况。如果可能的话，你可以咨询我，我会根据你的具体情况为你提供更具体的法律建议。