结论：在特定情况下，起诉总公司确实有可能执行分公司的资产，但这并非绝对，需要依据具体情况和法律规定来判断。
一、法律背景与原则
法人独立原则：根据《公司法》的相关规定，总公司与分公司是两个独立的法律实体，分公司虽然不具有独立的法人资格，但其财产仍属于分公司所有，只是在法律上视为总公司的财产一部分。在一般情况下，分公司的债务应由总公司承担，但这并不意味着可以直接执行分公司的资产来偿还总公司的债务。
执行程序中的特殊情况：在执行程序中，如果总公司作为被执行人，且其财产不足以清偿债务，法院在特定情况下可以裁定执行分公司的财产。这通常发生在分公司有独立财产，且这些财产与总公司的财产可以明确区分的情况下。
二、可能执行分公司资产的情况
分公司有独立财产且可区分：如果分公司拥有独立的财产，如独立的银行账户、房产、设备等，且这些财产在法律上可以明确区分于总公司的财产，那么在总公司财产不足以清偿债务时，法院有可能裁定执行这些财产。
分公司作为共同被执行人：在某些情况下，如果分公司也参与了相关法律行为，且根据法律规定或合同约定应承担连带责任，那么分公司可能被列为共同被执行人。在这种情况下，法院可以直接执行分公司的资产。
总公司与分公司财产混同：如果总公司与分公司的财产存在混同，即无法明确区分哪些财产属于总公司，哪些属于分公司，那么法院在执行时可能会将分公司的财产视为总公司的财产一并执行。但这种情况需要法院进行详细的调查和认定。
三、法律建议与风险提示
充分了解法律程序：在起诉总公司并试图执行分公司资产之前，应充分了解相关的法律程序和规定，确保自己的诉求有法律依据。
收集充分证据：为了证明分公司有独立财产或存在财产混同等情况，需要收集充分的证据来支持自己的主张。这可能包括分公司的财务报表、银行账户记录、房产证明等。
谨慎选择执行策略：在执行过程中，应根据具体情况和法律规定谨慎选择执行策略。如果直接执行分公司的资产存在困难或风险，可以考虑其他执行方式，如申请强制执行总公司的其他财产或要求分公司承担连带责任等。
咨询专业律师：由于涉及复杂的法律问题和程序，建议在起诉和执行过程中咨询专业律师的意见和帮助。我可以为你提供公司事务、股权转让领域的专业法律咨询和服务，帮助你更好地维护自己的合法权益。
四、可能面临的法律后果
如果未经充分调查和认定就试图执行分公司的资产，可能会面临执行失败的风险。此外，如果错误地执行了分公司的财产，还可能面临被分公司起诉要求赔偿的风险。因此，在起诉和执行过程中务必谨慎行事，确保自己的诉求有法律依据和充分证据支持。