针对您提出的“省退休3年多后干部被纪检留置怎么办”的问题，这是一个涉及退休公职人员违纪违法案件处理的复杂问题。以下是我根据相关法规和政策，为您提供的详细解答：

一、立案程序的启动

对于退休前或退休后有违纪违法行为的公职人员，如果其为中共党员，由于纪律审查没有追究时效限制，可以进行党纪立案。如果非中共党员，依据《监察法》和《政务处分法》的相关规定，监察机关同样可以立案调查，并不因其退休而不能管辖。在您的案例中，该退休干部已被纪检留置，说明监察机关已经启动了立案程序。

二、立案主体的确定

公职人员不因退休而改变原干部管理权限，对其立案应根据办理退休手续时的干部管理权限确定立案主体。如果该退休干部退休后党组织关系发生了转移，导致与干部管理权限相分离，那么根据党组织隶属关系，相关纪委具有优先管辖权。但如违纪行为主要发生在原工作地，由原工作地调查更为适宜的，经协商也可以进行立案。在您的案例中，具体立案主体应由相关部门根据干部管理权限和党组织关系来确定。

三、立案种类的适用

如发现公职人员退休或离职前涉嫌职务犯罪行为，只要未超过刑法规定的追诉时效，监察机关即有权进行政务立案，并区分情况是否移送审查起诉。在您的案例中，如果该退休干部涉嫌职务犯罪，且未超过追诉时效，那么监察机关将进行政务立案，并可能根据调查结果决定是否移送审查起诉。

四、退休待遇的调整

对于严重违纪违法的退休公职人员，其退休待遇可能会受到影响。实践中，调整退休待遇主要有三种方式：一是在党纪处分决定文书中直接表述待遇调整事项；二是参照政务重处分决定书要求，单独作出《关于调整××退休待遇的决定》；三是将“相应调整其享受的待遇”书面通知同级党委组织部门和所在单位按程序予以落实。在您的案例中，如果该退休干部被认定有违纪违法行为，其退休待遇可能会根据相关规定进行调整。

五、后续处理建议

1. 配合调查：该退休干部应积极配合纪检部门的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
2. 了解权利：在调查过程中，该退休干部有权了解自己的权利和义务，包括申诉救济权等。
3. 等待处理结果：调查结束后，纪检部门将根据调查结果作出相应的处理决定。该退休干部应耐心等待处理结果，并根据处理结果采取相应的行动。

六、注意事项

1. 保持冷静：面对留置和调查，该退休干部应保持冷静，不要惊慌失措或采取过激行为。
2. 寻求法律帮助：如有需要，该退休干部可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自己的合法权益。
3. 遵守纪律规定：在调查期间，该退休干部应严格遵守纪律规定，不得干扰调查工作或泄露调查信息。

综上所述，省退休3年多后干部被纪检留置是一个复杂的问题，需要综合考虑多个方面的因素。希望以上解答能对您有所帮助。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询相关部门或专业人士。