针对您提出的“车辆被盗后发生事故保险公司是否赔偿”的问题，这确实是一个涉及多方面因素的复杂情况。以下是我为您详细梳理的解答：
一、赔偿情况分析
交强险赔偿：
- 根据相关法律法规，交强险主要保障交通事故中第三方受害人的权益。因此，在车辆被盗期间发生交通事故，对于第三方的急救费用，保险公司通常需要在交强险责任限额范围内进行赔偿。但请注意，对于第三方的人身财产损害赔偿，一般不由交强险直接承担，而是应由盗窃者负责。
盗抢险赔偿：
- 如果您购买了盗抢险，并且事故符合盗抢险的条款约定，那么保险公司将对车辆自身的损失进行赔偿。这包括车辆被盗超过一定时间（如三个月）未找回时的全额赔偿，以及车辆在找回但受损或零件丢失时的修复费用（通常按一定比例，如80%赔偿）。
其他商业险赔偿：
- 对于第三者责任险等其他商业险，如果车辆在被盗期间发生事故导致第三方人身伤亡或财产损失，并且满足一定条件（如经公安刑侦部门立案证实，不属于驾驶人故意行为等特定免责情形），保险公司也可能承担赔偿责任。但具体赔偿情况需根据保险合同条款来确定。
二、免责情况说明
未购买相关保险：
- 如果您未购买盗抢险或其他相关商业险，那么车辆被盗及因此发生的事故损失，保险公司将不予赔偿。
车主过失：
- 如果车主因自身过失（如未妥善保管车辆钥匙、未安装防盗设备等）导致车辆被盗，保险公司可能根据合同条款免责或部分免责。
特定场所被盗：
- 如果车辆在收费停车场、维修厂等有人看管的地方被盗抢，并且保险合同中有相关免责条款，保险公司可能不负责赔偿。
债务纠纷或恶意行为：
- 因债务纠纷等原因导致的车辆被非法转移或开走，以及盗窃者故意制造交通事故等恶意行为，如果属于保险合同明确约定的免责范围，保险公司将拒绝赔偿。
三、理赔流程建议
及时报案：
- 在车辆被盗或发生事故后，您应立即联系保险公司并报案，同时向公安机关报案以获取立案证明。
准备相关证件：
- 出示本车行驶证、驾驶员的驾驶证（如适用）、被保人的身份证及保险单等必要证件，以便保险公司进行理赔审核。
配合定损与修理：
- 配合保险公司进行车辆损坏情况的初步检查，并按照要求填写案件审批表。随后，保险公司将安排照相定损，并给出处理意见。在修理完毕后，带齐所有证件及修车发票到指定地点接车。
委托索赔（如适用）：
- 如果您希望简化理赔流程，可以委托修理处代理索赔事宜。但请确保修理处具有合法的代理资格，并了解相关代理费用。
总结与建议：
车辆被盗期间发生事故后，保险公司的赔偿责任需根据具体的保险种类、合同条款以及实际情况来综合判断。因此，我建议您在购买保险时仔细阅读合同条款，了解保险责任与免责范围。同时，加强车辆的安全防范措施，如安装防盗设备、妥善保管车辆钥匙等，以降低车辆被盗的风险。在需要时，及时联系保险公司并启动理赔流程，以便迅速有效地维护自己的合法权益。