乡镇经管站管理村委会公章的行为是否违法，不能一概而论，需结合具体情况和相关法律法规进行综合分析。以下从不同角度进行详细阐述：
一、公章管理的基本原则
村委会公章是村委会行使职权、履行职责的重要凭证，其管理应遵循民主、公开、规范的原则。根据《村民委员会组织法》等相关法律法规，村委会公章应由村委会自行管理，确保公章使用的合法性和规范性。
二、乡镇经管站管理村委会公章的合法性分析
合法情形：
- 委托管理：如果村委会因特殊原因（如人员变动、公章遗失等）需要暂时委托乡镇经管站管理公章，且双方签订了书面委托协议，明确了管理权限、期限和责任等事项，那么这种管理行为在委托期限内是合法的。
- 协助管理：在某些情况下，乡镇经管站可能根据上级指示或村委会的请求，协助村委会进行公章管理，如提供公章保管场所、监督公章使用等。这种协助管理行为，如果符合相关法律法规和政策要求，且未侵犯村委会的自治权，也是合法的。
违法情形：
- 擅自管理：如果乡镇经管站未经村委会同意，擅自管理村委会公章，或者超越委托权限使用公章，那么这种行为就构成了对村委会自治权的侵犯，是违法的。
- 滥用职权：如果乡镇经管站在管理公章过程中，存在滥用职权、谋取私利等违法行为，如违规使用公章为个人或他人谋取利益，那么这种行为不仅违法，还可能构成犯罪。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 对于擅自管理或滥用职权的乡镇经管站工作人员，可能面临行政处分、民事赔偿甚至刑事责任等法律后果。
- 对于村委会而言，如果因公章管理不善导致损失，可以依法追究相关责任人的法律责任。
建议：
- 完善公章管理制度：村委会应建立健全公章管理制度，明确公章的保管、使用、审批等流程，确保公章使用的合法性和规范性。
- 加强监督与检查：乡镇政府应加强对村委会公章管理的监督与检查，确保公章管理符合相关法律法规和政策要求。
- 及时沟通与协商：如果村委会需要委托乡镇经管站管理公章，应签订书面委托协议，明确双方的权利和义务，避免产生纠纷。
- 依法维权：如果村委会发现乡镇经管站存在违法管理公章的行为，应及时向上级政府或相关部门反映情况，并依法维护自己的合法权益。
总结来说，乡镇经管站管理村委会公章的行为是否违法，取决于具体的管理方式、权限和目的等因素。如果符合相关法律法规和政策要求，且未侵犯村委会的自治权，那么这种管理行为是合法的；反之，则是违法的。因此，在实际操作中，应严格遵守相关法律法规和政策要求，确保公章管理的合法性和规范性。如果你在这方面有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，可以直接向我咨询。