双方买卖合同中约定的违约金在符合法律法规、基于真实意思表示、数额合理且违约情形明确约定的条件下是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、违约金的合法性基础
根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这一条款为买卖合同中违约金的合法性提供了明确的法律基础。
二、合法情形的具体条件
真实意思表示：
- 买卖合同中的违约金条款必须是双方当事人在平等、自愿、公平的基础上，经过充分协商后达成的真实意思表示。这要求合同签订过程中不存在欺诈、胁迫等导致合同无效或可撤销的情形。
违约金数额合理性：
- 约定的违约金数额应当与可能造成的损失相当，既不过高也不过低。如果违约金数额不合理，当事人可以请求人民法院或仲裁机构进行适当调整。例如，如果约定的违约金过分高于实际造成的损失（通常指超过损失的30%），人民法院或仲裁机构可根据当事人的请求适当减少；反之，如果约定的违约金低于实际造成的损失，也可以请求增加。
违约情形明确性：
- 买卖合同中应明确列出哪些情况构成违约，以便在一方违反合同时能够准确判断是否需要支付违约金。例如，明确规定买方未按时支付货款或卖方未按时交付货物等行为属于违约，需支付违约金。
三、实际操作建议
合理约定违约金：
- 在签订买卖合同时，双方应基于平等自愿的原则，合理约定违约金的数额和计算方式。确保违约金既能有效督促合同履行，又不会过分加重任何一方的责任。例如，可以根据货物的价值、交易习惯、市场风险等因素来综合考虑违约金的数额。
明确违约情形和后果：
- 在合同中详细列出违约情形和相应的后果，包括违约金的支付条件、支付方式等。这有助于减少合同履行过程中的争议和纠纷。
及时咨询和调整：
- 如果在合同履行过程中发现违约金条款存在问题或需要调整，应及时与对方协商并咨询专业律师的意见。确保合同的合法性和有效性，并维护自身的合法权益。
四、特殊情况下的处理
违约行为并未实际发生或未造成损失：
- 如果不存在违约行为或者虽然存在一定的偏差但并未给对方造成实际损失，对方要求收取违约金可能不合理。此时，可以拒绝支付违约金或请求人民法院或仲裁机构进行裁决。
合同未约定违约金的情况：
- 如果合同中没有约定违约金条款，但一方存在违约行为并给对方造成损失的情况下，受损方有权要求违约方承担赔偿责任。这种赔偿责任在一定程度上类似于违约金的性质，但需要根据实际损失进行计算和赔偿。
总结来说，双方买卖合同中约定的违约金在符合法律法规、基于真实意思表示、数额合理且违约情形明确约定的条件下是合法的。在签订和履行买卖合同时，双方应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。