在公司宿舍楼顶种菜是否违法，需分情况讨论：

1. 若公司允许或未明确禁止：

   • 在这种情况下，员工在公司宿舍楼顶种菜通常不构成违法行为。但需要注意的是，即便公司允许，员工在种菜时也应确保不破坏楼顶结构、不影响楼顶排水系统、不造成安全隐患，并且需遵守公司关于楼顶使用的其他相关规定。例如，不能在楼顶搭建永久性建筑或进行大规模改造，以免违反建筑安全或城市规划等相关法规。

2. 若公司明确禁止：

   • 如果公司有明确的规章制度禁止员工在公司宿舍楼顶种菜，那么员工擅自种菜就可能构成违反公司规章制度的行为。公司有权根据规章制度对员工进行相应的处理，如警告、罚款甚至解除劳动合同等。此外，如果种菜行为导致了公司财产的损失（如破坏了楼顶防水层、造成了排水堵塞等），员工还可能需要承担赔偿责任。

3. 从法律层面分析：

   • 从更广泛的法律角度来看，公司宿舍楼顶通常属于公司的财产或管理范围。员工在使用公司财产或管理范围时，应遵守相关法律法规和公司的规章制度。如果种菜行为违反了相关法律法规（如建筑安全法规、城市规划法规等）或公司的规章制度，那么就可能面临法律责任或公司内部的纪律处分。
   • 具体来说，如果种菜行为导致了楼顶结构受损、影响了楼顶的正常使用功能（如排水、通风等），或者对周边环境造成了不良影响（如噪音、异味等），那么就可能触犯了相关法律法规，需要承担相应的法律责任。

建议：

• 在决定在公司宿舍楼顶种菜前，员工应先了解公司的相关规章制度和法律法规的要求。
• 如果公司允许种菜，员工应确保种菜行为不会对公司财产和环境造成不良影响，并遵守公司的相关规定。
• 如果公司禁止种菜或员工对相关规定不明确，建议员工不要擅自种菜，以免引发不必要的法律纠纷或公司内部的纪律处分。

如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。