在处理摩托车与电动车发生的事故时，是否扣车主要取决于事故的具体情况以及当地交通管理部门的判断。以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
一、扣车的一般情况
在摩托车与电动车发生事故后，如果交通管理部门认为有必要保留事故现场证据，或者事故涉及严重违法行为（如酒驾、超速、闯红灯等），或者存在人员伤亡，那么交通管理部门有权依法扣留相关车辆，以便进行进一步的调查和处理。
二、扣车的法律依据
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及其相关实施条例，交通管理部门在特定情况下有权扣留车辆。这通常是为了确保事故调查的顺利进行，以及保护事故现场的证据不被破坏。
三、扣车后的处理流程
车辆扣留：交通管理部门会出具扣留车辆的相关文书，并告知车主或驾驶人扣留的原因、期限以及申诉途径。
事故调查：在车辆扣留期间，交通管理部门会对事故进行调查，包括收集证据、询问当事人、查看监控录像等。
责任认定：根据调查结果，交通管理部门会出具事故责任认定书，明确各方在事故中的责任。
车辆放行：如果事故调查完毕且无需进一步扣留车辆，或者车主或驾驶人已经接受了相应的处罚并履行了相关义务，交通管理部门会放行车辆。
四、关于拖车费的问题
关于事故后是否需要支付拖车费，这主要取决于当地的具体规定和实际情况。一般来说，如果车辆是因为违反交通规定而被拖走的，且拖车行为是由交通管理部门直接实施的，那么根据相关法律规定，车主或驾驶人通常不需要支付拖车费用。然而，如果车辆是因为事故损坏无法自行移动而被拖走的，且拖车行为是由第三方（如停车场或拖车公司）实施的，那么可能需要支付一定的拖车费用。但这一费用通常应由物价部门核定，并在停车场内有公示牌进行公示。
五、建议
在事故发生后，保持冷静并配合交通管理部门的调查和处理工作。
如果对扣车或拖车费有疑问或不满，可以及时向交通管理部门提出申诉或咨询相关法律条款。
在处理事故过程中，注意保留好相关证据和文书，以便后续维权或申诉。
综上所述，摩托车与电动车发生事故后是否扣车取决于事故的具体情况和当地交通管理部门的判断。在处理过程中，车主或驾驶人应积极配合交通管理部门的工作，并了解自己的权利和义务。