有贷款逾期确实可能会影响农村信用社三年合同贷款的申请与审批，具体影响程度需结合逾期情况、信用社政策及合同条款综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

1. 逾期记录对信用评估的影响
   贷款逾期会直接反映在个人征信报告中，成为信用评估的重要负面因素。农村信用社在审批三年期贷款时，通常会通过查询征信报告评估借款人的还款意愿和能力。若逾期次数较多、金额较大或逾期时间较长（如超过90天），信用社可能认为借款人存在较高违约风险，从而拒绝贷款申请或提高贷款利率、缩短贷款期限、要求增加担保措施等。

2. 合同条款的约束性
   若你已与农村信用社签订了三年期贷款合同，但后续出现其他贷款逾期，需重点审查原合同中是否包含“交叉违约”或“重大不利变化”条款。此类条款通常规定，若借款人在其他金融机构的贷款出现逾期，即使本合同未到期，信用社也有权宣布贷款提前到期、要求提前还款或采取其他风险控制措施。若合同中有此类条款，逾期可能直接触发信用社的追责机制。

3. 信用社政策与风控标准
   不同农村信用社的风控政策存在差异。部分信用社可能对逾期记录采取“零容忍”态度，尤其是对经营性贷款或大额贷款；而另一些信用社可能更关注借款人的整体还款能力（如收入稳定性、资产状况等），若逾期金额较小或已结清，可能不会对三年期贷款产生实质性影响。此外，若逾期是由于特殊原因（如自然灾害、重大疾病等）导致，且能提供相关证明，信用社可能酌情考虑。

4. 逾期后的补救措施
   若你目前存在逾期记录，但希望申请或维持农村信用社的三年期贷款，可采取以下措施：

   • 结清逾期贷款：尽快偿还逾期本息，减少负面记录的影响时长（征信报告中的逾期记录会保留5年，但结清后影响逐渐减弱）；
     
   • 提供增信材料：如增加抵押物、提供保证人或展示稳定的收入来源，以增强信用社对还款能力的信心；
     
   • 与信用社沟通：主动说明逾期原因（如非恶意逾期、临时资金周转困难等），并提交相关证明材料，争取信用社的理解与支持。

建议：若你已签订三年期贷款合同，需仔细审查合同条款，确认是否存在交叉违约等风险条款；若尚未申请，可先通过央行征信中心查询个人征信报告，了解逾期记录的具体情况，再结合信用社政策评估贷款可行性。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合你的具体情况提供更精准的建议。