核心结论：农村信用社贷款合同签了三年，这中间夫妻一方有逾期贷款，可能会影响该笔三年期贷款，具体影响程度需分情况讨论。以下从不同角度进行分析：

1. 贷款性质角度

   • 若该三年期贷款为夫妻共同债务：根据《民法典》及相关司法解释，夫妻双方共同签名或者夫妻一方事后追认等共同意思表示所负的债务，以及夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义为家庭日常生活需要所负的债务，属于夫妻共同债务。在这种情况下，夫妻一方出现逾期贷款，说明其信用状况和还款能力可能出现问题，农村信用社在评估夫妻共同债务的还款风险时，会综合考虑夫妻双方的信用情况。因为夫妻一方逾期，整体家庭信用受损，信用社可能会认为该家庭偿还三年期贷款的能力下降、风险增加，从而可能采取提前收回贷款、要求增加担保措施（如提供更多抵押物或保证人）、提高贷款利率等措施来降低自身风险。
   • 若该三年期贷款仅为夫妻一方个人债务：即贷款合同上只有夫妻一方签字，且该贷款并非用于家庭共同生活、共同生产经营等家庭共同目的。此时，从理论上来说，另一方的逾期贷款情况对该笔个人债务的影响相对较小。但是，农村信用社在贷款管理过程中，也会关注借款人的家庭整体经济状况和信用环境。如果一方逾期情况较为严重，引发了一系列不良后果，如被起诉、列入失信被执行人名单等，可能会对家庭的经济稳定性和信用氛围产生负面影响，信用社也可能会出于谨慎考虑，对该笔三年期个人贷款进行重新评估，例如要求借款人提供更多的还款能力证明等。

2. 信用记录角度

   • 夫妻一方逾期贷款会记录在个人征信报告中：在我国，个人征信系统是全面记录个人信用信息的重要平台，夫妻一方的逾期贷款信息会被如实记录在其个人征信报告里。而农村信用社在审批和管理贷款时，通常会查询借款人及其配偶的征信报告。当信用社发现夫妻一方有逾期记录时，会认为该家庭存在信用风险。即使三年期贷款的借款人信用良好，信用社也可能会因为其配偶的逾期情况而对该笔贷款的风险评估产生变化，进而影响贷款的正常履行，比如可能会限制借款人使用贷款资金的部分功能、缩短贷款期限等。

3. 信用社内部政策角度

   • 不同农村信用社可能有不同的风险管控政策：一些信用社可能对借款人的家庭信用状况有较为严格的要求，只要夫妻一方出现逾期，无论是否与该笔三年期贷款直接相关，都会采取较为严格的措施来防范风险。而另一些信用社可能会根据逾期贷款的金额、逾期时间、逾期原因等因素进行综合判断。如果逾期金额较小、逾期时间较短且是由于特殊原因（如突发重大疾病、意外事故等不可抗力因素）导致的，信用社可能不会对该笔三年期贷款采取过于激进的措施；但如果逾期金额较大、逾期时间较长且无明显合理原因，信用社则很可能会对该笔贷款产生不利影响。

如果遇到此类情况，建议你及时与农村信用社沟通，说明逾期原因和目前的还款能力等情况，争取信用社的理解和支持，同时按照合同约定履行还款义务，避免进一步影响个人和家庭的信用状况。如果你还有其他关于贷款法律方面的问题，可以直接向我咨询。