结论：在有限公司中，法人代表（通常指法定代表人）在合伙人不知情的情况下，一般不可以擅自代出款项，否则可能构成违法行为并需承担相应法律责任。以下从多个角度进行详细分析：

1. 公司法角度：

   • 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司的财产属于公司所有，而非股东或法定代表人个人所有。法定代表人作为公司的代表，其职责是管理公司事务，而非随意处置公司财产。
   • 法定代表人若未经股东会或董事会等决策机构同意，擅自将公司款项转出，可能构成对公司财产的侵占或挪用，违反公司法的规定。

2. 合同法角度：

   • 如果法定代表人以公司名义与第三方签订合同，并擅自将公司款项支付给第三方，而该行为未经公司内部决策程序同意，那么该合同可能因缺乏公司真实意思表示而面临效力争议。
   • 在极端情况下，如果法定代表人与第三方恶意串通，损害公司利益，那么该合同可能被认定为无效合同。

3. 刑事责任角度：

   • 法定代表人擅自代出款项，如果数额较大且构成犯罪，如挪用资金罪或职务侵占罪，将可能面临刑事追究。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，挪用资金罪和职务侵占罪都是严重的犯罪行为，一旦定罪，将可能面临有期徒刑、拘役或罚金等刑罚。

4. 民事责任角度：

   • 即使法定代表人的行为不构成犯罪，但如果给公司造成损失，公司仍有权要求其承担民事赔偿责任。
   • 合伙人作为公司的股东，也有权要求法定代表人赔偿因其擅自代出款项而给公司造成的损失。

建议：

• 作为公司的法定代表人，应严格遵守公司法和相关法律法规的规定，不得擅自处置公司财产。
• 在进行任何重大财务决策时，应经过公司内部决策程序的同意，并确保决策的合法性和合规性。
• 如果合伙人发现法定代表人有擅自代出款项的行为，应及时采取措施保护公司利益，如召开股东会或董事会进行决议、向相关部门举报或提起诉讼等。