结论：周末加班一天，公司已经发了一天工资的情况下，是否还应补发工资，这主要取决于加班的性质以及公司是否已与员工就加班工资支付达成明确约定。一般来说，若周末加班属于休息日加班且不能安排补休的，公司应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬，即除已发的一天工资外，还应补发一天工资。
分析说明：
休息日加班工资支付规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这意味着，如果员工在周末（通常是休息日）加班，且公司无法安排补休，那么公司除了支付员工正常的一天工资外，还应额外支付一天工资作为加班费。
加班性质与工资支付：
- 周末加班可能属于休息日加班，也可能属于特殊情况下的加班（如法定节假日加班，但周末本身通常不是法定节假日）。对于休息日加班，如上述规定，应支付双倍工资。
- 如果公司已经与员工就加班工资支付达成明确约定，且该约定不低于法定标准，那么应按照约定执行。但在此案例中，公司仅支付了一天工资，未提及补发，因此需依据法定标准来判断。
公司已发一天工资的情况：
- 公司已经支付了一天工资，这可能是员工正常工作日的工资或已包含部分加班费（但通常不会仅包含休息日加班的全部加班费）。
- 若要确定是否还应补发，需明确这已发的一天工资是仅作为正常工作日的工资还是已包含部分加班费。在无明确约定的情况下，应倾向于认为这是正常工作日的工资，因此公司还应补发一天工资作为休息日加班的加班费。
特殊场景：
- 如果公司能够安排员工在其他时间补休，那么可能不需要支付额外的加班费。但在此案例中，未提及补休安排，因此应默认需要支付加班费。
行动建议：
- 与公司沟通：首先，建议员工与公司沟通，明确加班的性质以及公司对于加班工资的支付政策。
- 查看劳动合同和规章制度：员工应查看自己的劳动合同以及公司的规章制度，了解其中关于加班工资支付的具体规定。
- 寻求法律援助：如果与公司沟通无果，且员工认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。
计算公式（若需计算具体加班费）：
- 假设员工日工资为W元，则周末加班一天的加班费应为2W元（不低于工资的百分之二百）。
- 公司已支付W元，因此还应补发W元。
最终答案：在周末加班且不能安排补休的情况下，公司除已发的一天工资外，还应补发一天工资作为加班费。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。