当自然人与公司发生民间借贷，而公司现已注销时，列被告的情况需根据公司的清算状态及股东责任来确定。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司正常清算注销的情况
清算义务人责任：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记。若公司已依法完成清算程序并注销，原则上公司作为法律主体的资格已消灭，无法再作为被告。
- 但若清算义务人（通常为公司股东或董事）在清算过程中存在过错，如未依法通知债权人、未依法进行清算等，导致债权人利益受损的，债权人可以要求清算义务人承担赔偿责任。此时，清算义务人可作为被告。
股东责任：
- 在公司注销后，若股东存在未缴或未足额缴纳出资的情况，且该出资未用于清偿公司债务，债权人可以要求股东在未缴出资范围内对公司债务承担清偿责任。此时，股东可作为被告。
- 若股东在公司注销过程中存在恶意处置公司财产、虚构债务或承认不真实的债务等行为，损害债权人利益的，债权人也可以要求股东承担赔偿责任。
二、公司未依法清算即注销的情况
股东或实际控制人责任：
- 若公司未经依法清算即办理注销登记，导致公司无法进行清算的，债权人可以主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。此时，股东、董事、控股股东或实际控制人可作为被告。
清算义务人连带责任：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》的相关规定，公司未经清算即办理注销登记，债权人主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任的，人民法院应依法予以支持。若清算义务人存在故意或重大过失，还可能承担连带责任。
三、实际操作建议
收集证据：
- 收集与公司之间的借贷合同、转账记录、公司注销的相关文件（如清算报告、注销登记通知书等）以及能够证明公司未依法清算或股东存在过错的证据。
确定被告：
- 根据上述分析，结合收集到的证据，确定可能的被告主体，如清算义务人、股东、董事、控股股东或实际控制人等。
提起诉讼：
- 向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求被告承担相应的赔偿责任。在诉讼过程中，注意提供充分的证据支持自己的主张。
示例说明：
假设您与公司A签订了借贷合同，公司A在未通知您的情况下进行了清算并注销。您发现后，可以收集借贷合同、转账记录以及公司A注销的相关文件作为证据。若能够证明公司A未依法清算或股东存在过错，您可以将股东作为被告提起诉讼，要求其承担赔偿责任。
特别提醒：在处理此类案件时，建议尽快行动，以免因时效问题而丧失维权机会。同时，由于每个案件的具体情况不同，建议在提起诉讼前咨询专业律师（即我本人，吴多多律师，专注于离婚财产纠纷、遗产继承、离婚、抚养权、婚姻家庭、法律顾问领域），以便更准确地把握案件走向和维权策略。