当分公司注销以后，确定如何列被告确实是一个相对复杂的问题，这主要取决于分公司注销前的行为以及注销的具体情况。以下是一些详细的解答和建议：
首先，我们要明确一点，已经注销的分公司，在一般情况下，不能作为被告。因为分公司经注销登记后，其法律主体资格已经消灭，不再具有民事行为能力和诉讼权利能力。
然而，也存在一些特定情形，在这些情形下，已注销的分公司可能会被列为被告：
分公司注销前实施的民事行为：如果分公司在注销前与他人签订了合同，且未履行合同义务导致对方遭受损失，那么在一定条件下，对方可以将已注销的分公司作为被告起诉，要求其承担相应的民事责任。但这种情况下的起诉可能会涉及复杂的法律程序和风险，需要谨慎处理。
恶意逃避债务等违法情形：如果分公司注销存在恶意逃避债务等违法行为，相关责任人员，如公司实际控制人等，可能会被列为被告，以保障债权人的合法权益。
在确定被告时，除了考虑分公司本身，还可以考虑将总公司列为共同被告。因为分公司是总公司的分支机构，其民事责任通常由总公司承担。将总公司列为共同被告，有助于确保权利的有效维护。
此外，还有一些其他相关事项需要注意：
清算义务人的责任：如果公司注销是经过合法程序，但清算义务人未履行清算义务导致债务产生，那么清算义务人，如有限责任公司的股东等，也可能会被列为被告。
注销登记证明的重要性：注销登记证明是表明分公司已完成注销登记手续的文件，具有法律效力。在处理与分公司相关的法律事务时，注销登记证明是重要的凭证。
综上所述，当分公司注销后如何列被告，需要根据具体情况进行综合判断和处理。建议在实际操作中寻求专业法律人士的帮助，以确保合法权益得到有效维护。