在招投标法中，澄清程序通常在评标阶段进行。以下是对这一问题的详细分析：

澄清程序的目的与主体

澄清程序的主要目的是确保招标投标的公平、公正和透明，消除投标文件中的不明确、歧义或错误，从而保障所有投标人的合法权益。这一程序主要由招标采购单位（包括采购人或其委托的采购代理机构）启动，并在评标委员会的评审过程中进行。

澄清程序的具体实施阶段

1. 评标阶段发现需要澄清的问题：

   • 在评标过程中，评标委员会会仔细审查投标文件，若发现含义不明确、同类问题表述不一致或明显文字和计算错误的内容，会认为这些内容需要投标人进行进一步的澄清或说明。

2. 启动澄清程序：

   • 招标采购单位（或评标委员会受其委托）会正式启动澄清程序，向相关投标人发出澄清要求，明确指出需要澄清的问题，并要求投标人在规定时间内以书面形式进行答复。

3. 投标人进行澄清：

   • 投标人接到澄清要求后，必须按照招标文件的规定，以书面形式对需要澄清的问题进行详细、准确的说明或补正。这一过程中，投标人应确保澄清内容的真实性、准确性和完整性。

4. 评标委员会继续评审：

   • 评标委员会在收到投标人的澄清后，会进一步对投标文件进行评审，确保评审结果的公正性和准确性。如果澄清内容解决了原有问题，且不影响投标文件的实质性内容，那么该投标文件将继续参与后续的评标过程。

澄清程序的法律依据与注意事项

• 法律依据：

  • 根据《政府采购货物和服务招标投标管理办法》等相关法律法规的规定，评标委员会在评审过程中有权要求投标人对投标文件中的不明确内容进行澄清或说明。这为澄清程序的实施提供了明确的法律依据。

• 注意事项：

  • 澄清程序应在法律法规允许的范围内进行，不得违反相关法律法规的规定。
  • 招标采购单位在启动澄清程序时，应确保程序的公开、公平和公正，避免对任何投标人造成不公平的待遇。
  • 投标人应积极配合招标采购单位的澄清要求，及时、准确地提供所需信息，以确保招标活动的顺利进行。

实际应用中的案例

在实际招投标活动中，澄清程序的应用非常广泛。例如，在某个大型基础设施项目的招标中，评标委员会在评审过程中发现某投标人的技术方案中存在一处表述不清的地方，可能影响到对投标人技术能力的评估。于是，评标委员会向该投标人发出了澄清要求，要求其对技术方案中的该部分内容进行详细说明。投标人接到要求后，及时提交了书面澄清材料，对原技术方案进行了补充和解释。最终，评标委员会根据澄清后的技术方案对该投标人的技术能力进行了准确评估，并作出了公正的评标结果。

总结来说，招投标法中的澄清程序主要在评标阶段进行，旨在确保招标投标的公平、公正和透明。 如果您在招投标活动中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。