结论前置：工程进度款因监理不合规而影响支付时，首先需明确监理不合规的具体情形，再根据不同情况采取相应的法律措施来保障工程进度款的顺利支付。以下从多个角度进行分析：
一、监理不合规的具体情形及影响
监理不合规可能涉及多个方面，如监理报告不真实、监理程序违法、监理人员未尽职尽责等。这些不合规行为可能导致工程进度款的支付受到阻碍，因为建设单位可能基于监理的不合规报告或意见而拒绝或延迟支付工程进度款。
二、应对措施
与监理单位沟通：
- 首先，应尝试与监理单位进行沟通，明确指出其不合规行为，并要求其纠正。
- 如果监理单位承认错误并愿意纠正，可以要求其出具书面纠正意见，并据此向建设单位申请支付工程进度款。
向建设单位提出异议：
- 如果监理单位拒绝纠正或建设单位仍拒绝支付，可以向建设单位提出书面异议，详细说明监理不合规的情况及其对工程进度款支付的影响。
- 要求建设单位根据合同约定和实际情况，及时支付工程进度款。
申请行政复议或提起行政诉讼（如涉及行政监管）：
- 如果监理不合规行为涉及行政监管，且该行为对工程进度款支付产生了直接影响，可以考虑向相关行政机关申请行政复议或提起行政诉讼。
- 但这一步骤通常较为复杂，且需要一定的法律程序和时间成本，因此应谨慎选择。
依据合同约定提起民事诉讼：
- 如果与建设单位和监理单位的沟通均无果，且合同中有明确约定关于工程进度款支付的条件和程序，以及监理不合规时的处理方式，可以依据合同约定向法院提起民事诉讼。
- 在诉讼过程中，需要提供充分的证据证明监理的不合规行为以及该行为对工程进度款支付的影响。
三、法律建议
完善合同条款：
- 在签订建设工程合同时，应明确约定工程进度款的支付条件、程序以及监理不合规时的处理方式。
- 这样可以为后续可能出现的纠纷提供明确的法律依据。
加强过程管理：
- 在施工过程中，应加强对监理工作的监督和管理，确保监理单位按照合同约定和法律法规履行职责。
- 及时发现并纠正监理的不合规行为，避免其对工程进度款支付产生不利影响。
保留证据：
- 在与监理单位和建设单位沟通的过程中，应保留好相关证据，如书面沟通记录、监理报告、照片、视频等。
- 这些证据在后续可能出现的纠纷中将成为重要的法律依据。
四、可能的法律后果
如果因监理不合规而导致工程进度款无法及时支付，可能会引发一系列法律后果，如工期延误、违约金支付、诉讼费用承担等。因此，应尽快采取措施解决纠纷，避免损失扩大。
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