商运集团违规改装车辆，根据相关法律法规，会面临以下处罚：
行政处罚：
- 罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，违规改装车辆（如改变车辆结构、构造或特征等）的，由公安机关交通管理部门责令恢复原状，并处以罚款。罚款金额根据改装情节的严重性，通常在200元至2000元不等，具体数额需依据地方性法规或规章确定。
- 扣留车辆：在严重违规或拒不恢复原状的情况下，公安机关交通管理部门有权扣留车辆，直至违规行为得到纠正。
- 吊销驾驶证：若违规改装行为涉及驾驶人，且情节严重，可能面临驾驶证被吊销的处罚。
刑事责任：
- 如果改装行为导致严重后果（如发生重大交通事故，造成人员伤亡或财产损失），且改装行为与事故发生有直接因果关系，商运集团及相关责任人可能构成交通肇事罪或其他相关犯罪，需承担刑事责任。
其他责任：
- 民事赔偿：若违规改装车辆导致第三方受损，商运集团还需承担民事赔偿责任，包括赔偿受害人的医疗费用、财产损失等。
- 行业监管处罚：商运集团作为运输企业，还可能面临交通主管部门的行业监管处罚，如停业整顿、吊销运输经营许可证等。
建议：商运集团应严格遵守相关法律法规，不得擅自改装车辆。若需对车辆进行改装，应依法向相关部门申请并获得批准，确保改装行为合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。